Protein–RNA interactions for Protein: P57682

KLF3, Krueppel-like factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF3P57682 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLF3P57682 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KLF3P57682 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KLF3P57682 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLF3P57682 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLF3P57682 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLF3P57682 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLF3P57682 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLF3P57682 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLF3P57682 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLF3P57682 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLF3P57682 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLF3P57682 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLF3P57682 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLF3P57682 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLF3P57682 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLF3P57682 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLF3P57682 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLF3P57682 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLF3P57682 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
KLF3P57682 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLF3P57682 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLF3P57682 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
KLF3P57682 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLF3P57682 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLF3P57682 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLF3P57682 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
KLF3P57682 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLF3P57682 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLF3P57682 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLF3P57682 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLF3P57682 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLF3P57682 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLF3P57682 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLF3P57682 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLF3P57682 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLF3P57682 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLF3P57682 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLF3P57682 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLF3P57682 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLF3P57682 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLF3P57682 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
KLF3P57682 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLF3P57682 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLF3P57682 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLF3P57682 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLF3P57682 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLF3P57682 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLF3P57682 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLF3P57682 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLF3P57682 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLF3P57682 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLF3P57682 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLF3P57682 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLF3P57682 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLF3P57682 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLF3P57682 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLF3P57682 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLF3P57682 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLF3P57682 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLF3P57682 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLF3P57682 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLF3P57682 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
KLF3P57682 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLF3P57682 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLF3P57682 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLF3P57682 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLF3P57682 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLF3P57682 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLF3P57682 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLF3P57682 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLF3P57682 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLF3P57682 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLF3P57682 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
KLF3P57682 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLF3P57682 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLF3P57682 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLF3P57682 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLF3P57682 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLF3P57682 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLF3P57682 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLF3P57682 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLF3P57682 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLF3P57682 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLF3P57682 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLF3P57682 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLF3P57682 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLF3P57682 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLF3P57682 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLF3P57682 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLF3P57682 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLF3P57682 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLF3P57682 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLF3P57682 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLF3P57682 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLF3P57682 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLF3P57682 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLF3P57682 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLF3P57682 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLF3P57682 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms