Protein–RNA interactions for Protein: P53611

RABGGTB, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTBP53611 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RABGGTBP53611 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RABGGTBP53611 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RABGGTBP53611 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
RABGGTBP53611 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RABGGTBP53611 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RABGGTBP53611 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RABGGTBP53611 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RABGGTBP53611 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RABGGTBP53611 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RABGGTBP53611 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RABGGTBP53611 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RABGGTBP53611 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RABGGTBP53611 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RABGGTBP53611 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RABGGTBP53611 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RABGGTBP53611 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RABGGTBP53611 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RABGGTBP53611 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RABGGTBP53611 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RABGGTBP53611 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RABGGTBP53611 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RABGGTBP53611 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
RABGGTBP53611 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
RABGGTBP53611 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RABGGTBP53611 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RABGGTBP53611 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RABGGTBP53611 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
RABGGTBP53611 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
RABGGTBP53611 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RABGGTBP53611 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RABGGTBP53611 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RABGGTBP53611 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RABGGTBP53611 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RABGGTBP53611 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
RABGGTBP53611 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RABGGTBP53611 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
RABGGTBP53611 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RABGGTBP53611 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RABGGTBP53611 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RABGGTBP53611 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
RABGGTBP53611 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RABGGTBP53611 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RABGGTBP53611 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
RABGGTBP53611 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RABGGTBP53611 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RABGGTBP53611 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RABGGTBP53611 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RABGGTBP53611 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RABGGTBP53611 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RABGGTBP53611 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RABGGTBP53611 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RABGGTBP53611 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RABGGTBP53611 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
RABGGTBP53611 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RABGGTBP53611 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RABGGTBP53611 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RABGGTBP53611 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
RABGGTBP53611 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RABGGTBP53611 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RABGGTBP53611 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RABGGTBP53611 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
RABGGTBP53611 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RABGGTBP53611 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RABGGTBP53611 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RABGGTBP53611 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RABGGTBP53611 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RABGGTBP53611 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RABGGTBP53611 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RABGGTBP53611 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RABGGTBP53611 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RABGGTBP53611 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RABGGTBP53611 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
RABGGTBP53611 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RABGGTBP53611 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RABGGTBP53611 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RABGGTBP53611 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RABGGTBP53611 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RABGGTBP53611 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RABGGTBP53611 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RABGGTBP53611 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RABGGTBP53611 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RABGGTBP53611 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RABGGTBP53611 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
RABGGTBP53611 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RABGGTBP53611 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RABGGTBP53611 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RABGGTBP53611 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RABGGTBP53611 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RABGGTBP53611 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RABGGTBP53611 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RABGGTBP53611 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RABGGTBP53611 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RABGGTBP53611 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RABGGTBP53611 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RABGGTBP53611 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RABGGTBP53611 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RABGGTBP53611 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RABGGTBP53611 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RABGGTBP53611 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
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