Protein–RNA interactions for Protein: P51003

PAPOLA, Poly(A) polymerase alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPOLAP51003 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PAPOLAP51003 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PAPOLAP51003 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PAPOLAP51003 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PAPOLAP51003 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PAPOLAP51003 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PAPOLAP51003 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PAPOLAP51003 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PAPOLAP51003 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PAPOLAP51003 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PAPOLAP51003 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PAPOLAP51003 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PAPOLAP51003 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PAPOLAP51003 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PAPOLAP51003 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PAPOLAP51003 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PAPOLAP51003 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PAPOLAP51003 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PAPOLAP51003 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PAPOLAP51003 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PAPOLAP51003 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
PAPOLAP51003 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
PAPOLAP51003 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
PAPOLAP51003 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PAPOLAP51003 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PAPOLAP51003 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PAPOLAP51003 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PAPOLAP51003 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PAPOLAP51003 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PAPOLAP51003 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PAPOLAP51003 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PAPOLAP51003 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PAPOLAP51003 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PAPOLAP51003 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PAPOLAP51003 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PAPOLAP51003 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PAPOLAP51003 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PAPOLAP51003 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PAPOLAP51003 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PAPOLAP51003 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PAPOLAP51003 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PAPOLAP51003 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PAPOLAP51003 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PAPOLAP51003 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PAPOLAP51003 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PAPOLAP51003 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PAPOLAP51003 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PAPOLAP51003 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PAPOLAP51003 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PAPOLAP51003 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PAPOLAP51003 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PAPOLAP51003 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PAPOLAP51003 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PAPOLAP51003 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PAPOLAP51003 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PAPOLAP51003 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PAPOLAP51003 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PAPOLAP51003 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PAPOLAP51003 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PAPOLAP51003 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PAPOLAP51003 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PAPOLAP51003 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PAPOLAP51003 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PAPOLAP51003 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PAPOLAP51003 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PAPOLAP51003 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PAPOLAP51003 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PAPOLAP51003 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PAPOLAP51003 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PAPOLAP51003 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PAPOLAP51003 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PAPOLAP51003 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PAPOLAP51003 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PAPOLAP51003 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PAPOLAP51003 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PAPOLAP51003 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PAPOLAP51003 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
PAPOLAP51003 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PAPOLAP51003 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PAPOLAP51003 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PAPOLAP51003 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PAPOLAP51003 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PAPOLAP51003 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PAPOLAP51003 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PAPOLAP51003 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PAPOLAP51003 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PAPOLAP51003 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
PAPOLAP51003 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PAPOLAP51003 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PAPOLAP51003 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PAPOLAP51003 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PAPOLAP51003 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PAPOLAP51003 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PAPOLAP51003 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PAPOLAP51003 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PAPOLAP51003 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PAPOLAP51003 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PAPOLAP51003 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PAPOLAP51003 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PAPOLAP51003 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98 ms