Protein–RNA interactions for Protein: P48788

TNNI2, Troponin I, fast skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI2P48788 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
TNNI2P48788 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
TNNI2P48788 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
TNNI2P48788 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
TNNI2P48788 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
TNNI2P48788 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
TNNI2P48788 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
TNNI2P48788 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
TNNI2P48788 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
TNNI2P48788 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
TNNI2P48788 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
TNNI2P48788 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
TNNI2P48788 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
TNNI2P48788 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
TNNI2P48788 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
TNNI2P48788 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
TNNI2P48788 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
TNNI2P48788 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
TNNI2P48788 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
TNNI2P48788 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
TNNI2P48788 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
TNNI2P48788 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
TNNI2P48788 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
TNNI2P48788 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
TNNI2P48788 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
TNNI2P48788 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
TNNI2P48788 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
TNNI2P48788 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
TNNI2P48788 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC30.4■■■□□ 2.46
TNNI2P48788 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
TNNI2P48788 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
TNNI2P48788 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
TNNI2P48788 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
TNNI2P48788 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
TNNI2P48788 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
TNNI2P48788 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
TNNI2P48788 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
TNNI2P48788 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
TNNI2P48788 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
TNNI2P48788 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
TNNI2P48788 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
TNNI2P48788 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
TNNI2P48788 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.37■■■□□ 2.45
TNNI2P48788 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
TNNI2P48788 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
TNNI2P48788 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
TNNI2P48788 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
TNNI2P48788 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
TNNI2P48788 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
TNNI2P48788 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
TNNI2P48788 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
TNNI2P48788 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
TNNI2P48788 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
TNNI2P48788 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
TNNI2P48788 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
TNNI2P48788 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
TNNI2P48788 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
TNNI2P48788 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
TNNI2P48788 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
TNNI2P48788 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
TNNI2P48788 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
TNNI2P48788 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
TNNI2P48788 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.45
TNNI2P48788 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
TNNI2P48788 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
TNNI2P48788 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
TNNI2P48788 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
TNNI2P48788 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
TNNI2P48788 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
TNNI2P48788 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
TNNI2P48788 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
TNNI2P48788 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
TNNI2P48788 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
TNNI2P48788 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
TNNI2P48788 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
TNNI2P48788 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
TNNI2P48788 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
TNNI2P48788 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.44
TNNI2P48788 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
TNNI2P48788 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
TNNI2P48788 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
TNNI2P48788 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
TNNI2P48788 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
TNNI2P48788 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
TNNI2P48788 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
TNNI2P48788 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
TNNI2P48788 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
TNNI2P48788 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
TNNI2P48788 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
TNNI2P48788 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
TNNI2P48788 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
TNNI2P48788 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
TNNI2P48788 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
TNNI2P48788 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
TNNI2P48788 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
TNNI2P48788 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
TNNI2P48788 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TNNI2P48788 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
TNNI2P48788 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TNNI2P48788 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms