Protein–RNA interactions for Protein: P42947

YJL107C, Uncharacterized UPF0442 protein YJL107C, yeastyeast

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YJL107CP42947 PAU22YPL282C 495 nt7.81□□□□□ -1.16
YJL107CP42947 YEL034C-AYEL034C-A 603 nt7.8□□□□□ -1.16
YJL107CP42947 YOR343CYOR343C 327 nt7.8□□□□□ -1.16
YJL107CP42947 YPR084WYPR084W 1371 nt7.8□□□□□ -1.16
YJL107CP42947 AIM34YMR003W 597 nt7.79□□□□□ -1.16
YJL107CP42947 LAS17YOR181W 1902 nt7.78□□□□□ -1.16
YJL107CP42947 MRP1YDR347W 966 nt7.78□□□□□ -1.16
YJL107CP42947 CKB1YGL019W 837 nt7.78□□□□□ -1.16
YJL107CP42947 DST1YGL043W 930 nt7.78□□□□□ -1.16
YJL107CP42947 BXI1YNL305C 894 nt7.78□□□□□ -1.16
YJL107CP42947 RPS6AYPL090C 711 nt7.78□□□□□ -1.16
YJL107CP42947 RPS6BYBR181C 711 nt7.78□□□□□ -1.16
YJL107CP42947 PRC1YMR297W 1599 nt7.78□□□□□ -1.16
YJL107CP42947 ITR1YDR497C 1755 nt7.78□□□□□ -1.16
YJL107CP42947 ALR1YOL130W 2580 nt7.78□□□□□ -1.16
YJL107CP42947 GNP1YDR508C 1992 nt7.77□□□□□ -1.17
YJL107CP42947 TES1YJR019C 1050 nt7.77□□□□□ -1.17
YJL107CP42947 CDA1YLR307W 906 nt7.77□□□□□ -1.17
YJL107CP42947 YNL190WYNL190W 615 nt7.77□□□□□ -1.17
YJL107CP42947 RSC9YML127W 1746 nt7.77□□□□□ -1.17
YJL107CP42947 PDC5YLR134W 1692 nt7.76□□□□□ -1.17
YJL107CP42947 JHD1YER051W 1479 nt7.76□□□□□ -1.17
YJL107CP42947 YER156CYER156C 1017 nt7.76□□□□□ -1.17
YJL107CP42947 SNA3YJL151C 402 nt7.76□□□□□ -1.17
YJL107CP42947 HAM1YJR069C 594 nt7.76□□□□□ -1.17
YJL107CP42947 YMR206WYMR206W 942 nt7.76□□□□□ -1.17
YJL107CP42947 AOS1YPR180W 1044 nt7.76□□□□□ -1.17
YJL107CP42947 PEX28YHR150W 1740 nt7.75□□□□□ -1.17
YJL107CP42947 HXT9YJL219W 1704 nt7.75□□□□□ -1.17
YJL107CP42947 CHA1YCL064C 1083 nt7.75□□□□□ -1.17
YJL107CP42947 RRT6YGL146C 936 nt7.75□□□□□ -1.17
YJL107CP42947 PRE10YOR362C 867 nt7.75□□□□□ -1.17
YJL107CP42947 RFC1YOR217W 2586 nt7.75□□□□□ -1.17
YJL107CP42947 TIM50YPL063W 1431 nt7.75□□□□□ -1.17
YJL107CP42947 YER152CYER152C 1332 nt7.75□□□□□ -1.17
YJL107CP42947 MET30YIL046W 1923 nt7.74□□□□□ -1.17
YJL107CP42947 GDH1YOR375C 1365 nt7.74□□□□□ -1.17
YJL107CP42947 MNN9YPL050C 1188 nt7.74□□□□□ -1.17
YJL107CP42947 YAL016C-AYAL016C-A 315 nt7.73□□□□□ -1.17
YJL107CP42947 ADA2YDR448W 1305 nt7.73□□□□□ -1.17
YJL107CP42947 RPL12BYDR418W 498 nt7.72□□□□□ -1.17
YJL107CP42947 UTR5YEL035C 501 nt7.72□□□□□ -1.17
YJL107CP42947 SPE4YLR146C 903 nt7.71□□□□□ -1.18
YJL107CP42947 BEM1YBR200W 1656 nt7.7□□□□□ -1.18
YJL107CP42947 TAD2YJL035C 753 nt7.7□□□□□ -1.18
YJL107CP42947 RCF2YNR018W 675 nt7.7□□□□□ -1.18
YJL107CP42947 ARG7YMR062C 1326 nt7.7□□□□□ -1.18
YJL107CP42947 LEO1YOR123C 1395 nt7.7□□□□□ -1.18
YJL107CP42947 VPS65YLR322W 315 nt7.69□□□□□ -1.18
YJL107CP42947 ERV25YML012W 636 nt7.69□□□□□ -1.18
YJL107CP42947 YBL113CYBL113C 2379 nt7.68□□□□□ -1.18
YJL107CP42947 RUP1YOR138C 2016 nt7.68□□□□□ -1.18
YJL107CP42947 YLR030WYLR030W 792 nt7.68□□□□□ -1.18
YJL107CP42947 TOP3YLR234W 1971 nt7.67□□□□□ -1.18
YJL107CP42947 ELP4YPL101W 1371 nt7.67□□□□□ -1.18
YJL107CP42947 TDH1YJL052W 999 nt7.66□□□□□ -1.18
YJL107CP42947 ATP2YJR121W 1536 nt7.66□□□□□ -1.18
YJL107CP42947 YIL168WYIL168W 384 nt7.65□□□□□ -1.18
YJL107CP42947 tL(UAA)B1tL(UAA)B1 84 nt7.64□□□□□ -1.19
YJL107CP42947 tL(UAA)B2tL(UAA)B2 84 nt7.64□□□□□ -1.19
YJL107CP42947 tL(UAA)DtL(UAA)D 84 nt7.64□□□□□ -1.19
YJL107CP42947 SUP51tL(UAA)J 84 nt7.64□□□□□ -1.19
YJL107CP42947 tL(UAA)KtL(UAA)K 84 nt7.64□□□□□ -1.19
YJL107CP42947 tL(UAA)LtL(UAA)L 84 nt7.64□□□□□ -1.19
YJL107CP42947 tL(UAA)NtL(UAA)N 84 nt7.64□□□□□ -1.19
YJL107CP42947 PMU1YKL128C 888 nt7.64□□□□□ -1.19
YJL107CP42947 TOK1YJL093C 2076 nt7.63□□□□□ -1.19
YJL107CP42947 APT1YML022W 564 nt7.61□□□□□ -1.19
YJL107CP42947 YML034C-AYML034C-A 399 nt7.61□□□□□ -1.19
YJL107CP42947 YPC1YBR183W 951 nt7.61□□□□□ -1.19
YJL107CP42947 DCR2YLR361C 1737 nt7.61□□□□□ -1.19
YJL107CP42947 PMA2YPL036W 2844 nt7.6□□□□□ -1.19
YJL107CP42947 HNM1YGL077C 1692 nt7.6□□□□□ -1.19
YJL107CP42947 YHR033WYHR033W 1272 nt7.6□□□□□ -1.19
YJL107CP42947 TOS1YBR162C 1368 nt7.59□□□□□ -1.19
YJL107CP42947 ADE1YAR015W 921 nt7.59□□□□□ -1.19
YJL107CP42947 YOR041CYOR041C 432 nt7.59□□□□□ -1.19
YJL107CP42947 YKR018CYKR018C 2178 nt7.59□□□□□ -1.2
YJL107CP42947 PAB1YER165W 1734 nt7.58□□□□□ -1.2
YJL107CP42947 MAL31YBR298C 1845 nt7.58□□□□□ -1.2
YJL107CP42947 GNA1YFL017C 480 nt7.58□□□□□ -1.2
YJL107CP42947 CPR2YHR057C 618 nt7.58□□□□□ -1.2
YJL107CP42947 PET10YKR046C 852 nt7.58□□□□□ -1.2
YJL107CP42947 ATP10YLR393W 840 nt7.58□□□□□ -1.2
YJL107CP42947 YMR253CYMR253C 1245 nt7.58□□□□□ -1.2
YJL107CP42947 NUP53YMR153W 1428 nt7.58□□□□□ -1.2
YJL107CP42947 CSM2YIL132C 642 nt7.57□□□□□ -1.2
YJL107CP42947 STE3YKL178C 1413 nt7.56□□□□□ -1.2
YJL107CP42947 EDC2YER035W 438 nt7.56□□□□□ -1.2
YJL107CP42947 YJL043WYJL043W 774 nt7.56□□□□□ -1.2
YJL107CP42947 YDR215CYDR215C 414 nt7.55□□□□□ -1.2
YJL107CP42947 DAL80YKR034W 810 nt7.55□□□□□ -1.2
YJL107CP42947 YOR268CYOR268C 399 nt7.55□□□□□ -1.2
YJL107CP42947 RMD8YFR048W 1989 nt7.55□□□□□ -1.2
YJL107CP42947 ERR3YMR323W 1314 nt7.54□□□□□ -1.2
YJL107CP42947 ERR1YOR393W 1314 nt7.54□□□□□ -1.2
YJL107CP42947 ERR2YPL281C 1314 nt7.54□□□□□ -1.2
YJL107CP42947 TPI1YDR050C 747 nt7.54□□□□□ -1.2
YJL107CP42947 KAE1YKR038C 1161 nt7.54□□□□□ -1.2
YJL107CP42947 CAR2YLR438W 1275 nt7.54□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 10.9 ms