Protein–RNA interactions for Protein: P42858

HTT, Huntingtin, humanhuman

Predictions only

Length 3,142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTTP42858 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
HTTP42858 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
HTTP42858 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
HTTP42858 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
HTTP42858 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
HTTP42858 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
HTTP42858 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
HTTP42858 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
HTTP42858 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
HTTP42858 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
HTTP42858 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
HTTP42858 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
HTTP42858 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
HTTP42858 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
HTTP42858 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
HTTP42858 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
HTTP42858 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
HTTP42858 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
HTTP42858 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
HTTP42858 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
HTTP42858 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
HTTP42858 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
HTTP42858 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
HTTP42858 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
HTTP42858 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
HTTP42858 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
HTTP42858 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
HTTP42858 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
HTTP42858 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
HTTP42858 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
HTTP42858 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
HTTP42858 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
HTTP42858 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
HTTP42858 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
HTTP42858 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
HTTP42858 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
HTTP42858 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
HTTP42858 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
HTTP42858 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
HTTP42858 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
HTTP42858 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
HTTP42858 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
HTTP42858 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
HTTP42858 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
HTTP42858 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
HTTP42858 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
HTTP42858 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
HTTP42858 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
HTTP42858 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
HTTP42858 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
HTTP42858 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
HTTP42858 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
HTTP42858 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
HTTP42858 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC29.22■■■□□ 2.27
HTTP42858 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
HTTP42858 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
HTTP42858 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
HTTP42858 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
HTTP42858 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
HTTP42858 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
HTTP42858 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
HTTP42858 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
HTTP42858 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
HTTP42858 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
HTTP42858 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
HTTP42858 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
HTTP42858 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
HTTP42858 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
HTTP42858 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
HTTP42858 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
HTTP42858 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
HTTP42858 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
HTTP42858 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
HTTP42858 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
HTTP42858 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
HTTP42858 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
HTTP42858 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
HTTP42858 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
HTTP42858 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
HTTP42858 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
HTTP42858 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
HTTP42858 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
HTTP42858 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
HTTP42858 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
HTTP42858 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.14■■■□□ 2.25
HTTP42858 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
HTTP42858 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
HTTP42858 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
HTTP42858 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
HTTP42858 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
HTTP42858 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
HTTP42858 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
HTTP42858 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
HTTP42858 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
HTTP42858 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
HTTP42858 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
HTTP42858 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
HTTP42858 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
HTTP42858 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
HTTP42858 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms