Protein–RNA interactions for Protein: P40425

PBX2, Pre-B-cell leukemia transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX2P40425 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
PBX2P40425 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PBX2P40425 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PBX2P40425 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PBX2P40425 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PBX2P40425 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PBX2P40425 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
PBX2P40425 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PBX2P40425 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PBX2P40425 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PBX2P40425 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PBX2P40425 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
PBX2P40425 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PBX2P40425 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PBX2P40425 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PBX2P40425 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PBX2P40425 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PBX2P40425 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PBX2P40425 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PBX2P40425 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PBX2P40425 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PBX2P40425 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PBX2P40425 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PBX2P40425 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PBX2P40425 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PBX2P40425 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PBX2P40425 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PBX2P40425 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PBX2P40425 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PBX2P40425 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PBX2P40425 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PBX2P40425 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PBX2P40425 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PBX2P40425 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PBX2P40425 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PBX2P40425 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PBX2P40425 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
PBX2P40425 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PBX2P40425 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PBX2P40425 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PBX2P40425 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PBX2P40425 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PBX2P40425 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PBX2P40425 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PBX2P40425 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PBX2P40425 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PBX2P40425 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PBX2P40425 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PBX2P40425 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PBX2P40425 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PBX2P40425 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PBX2P40425 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PBX2P40425 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PBX2P40425 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PBX2P40425 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PBX2P40425 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PBX2P40425 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PBX2P40425 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PBX2P40425 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PBX2P40425 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
PBX2P40425 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PBX2P40425 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PBX2P40425 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PBX2P40425 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PBX2P40425 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
PBX2P40425 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PBX2P40425 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PBX2P40425 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PBX2P40425 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PBX2P40425 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PBX2P40425 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PBX2P40425 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PBX2P40425 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PBX2P40425 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PBX2P40425 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PBX2P40425 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PBX2P40425 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PBX2P40425 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PBX2P40425 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PBX2P40425 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PBX2P40425 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PBX2P40425 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
PBX2P40425 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PBX2P40425 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PBX2P40425 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PBX2P40425 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PBX2P40425 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.52■■■□□ 2
PBX2P40425 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
PBX2P40425 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
PBX2P40425 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PBX2P40425 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PBX2P40425 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PBX2P40425 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PBX2P40425 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PBX2P40425 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PBX2P40425 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PBX2P40425 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PBX2P40425 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PBX2P40425 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
PBX2P40425 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms