Protein–RNA interactions for Protein: P39548

YAR028W, DUP240 protein YAR028W, yeastyeast

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Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YAR028WP39548 YRF1-1YDR545W 5391 nt7.66□□□□□ -1.18
YAR028WP39548 YRF1-5YLR467W 5391 nt7.66□□□□□ -1.18
YAR028WP39548 YRF1-8YOR396W 5391 nt7.66□□□□□ -1.18
YAR028WP39548 PFS2YNL317W 1398 nt7.66□□□□□ -1.18
YAR028WP39548 APS2YJR058C 444 nt7.65□□□□□ -1.18
YAR028WP39548 ATG23YLR431C 1362 nt7.65□□□□□ -1.18
YAR028WP39548 CDS1YBR029C 1374 nt7.65□□□□□ -1.18
YAR028WP39548 MEP1YGR121C 1479 nt7.64□□□□□ -1.19
YAR028WP39548 ORM1YGR038W 669 nt7.64□□□□□ -1.19
YAR028WP39548 YIR035CYIR035C 765 nt7.64□□□□□ -1.19
YAR028WP39548 MDH2YOL126C 1134 nt7.64□□□□□ -1.19
YAR028WP39548 STD1YOR047C 1335 nt7.63□□□□□ -1.19
YAR028WP39548 ISR1YPR106W 1332 nt7.63□□□□□ -1.19
YAR028WP39548 NAS2YIL007C 663 nt7.63□□□□□ -1.19
YAR028WP39548 YJR149WYJR149W 1215 nt7.63□□□□□ -1.19
YAR028WP39548 DBR1YKL149C 1218 nt7.63□□□□□ -1.19
YAR028WP39548 BUB2YMR055C 921 nt7.63□□□□□ -1.19
YAR028WP39548 SPC24YMR117C 642 nt7.63□□□□□ -1.19
YAR028WP39548 KRE1YNL322C 942 nt7.63□□□□□ -1.19
YAR028WP39548 AME1YBR211C 975 nt7.63□□□□□ -1.19
YAR028WP39548 NDE2YDL085W 1638 nt7.63□□□□□ -1.19
YAR028WP39548 FRA1YLL029W 2250 nt7.62□□□□□ -1.19
YAR028WP39548 HSV2YGR223C 1347 nt7.62□□□□□ -1.19
YAR028WP39548 YHR140WYHR140W 720 nt7.62□□□□□ -1.19
YAR028WP39548 COX3Q0275 810 nt7.62□□□□□ -1.19
YAR028WP39548 YKR012CYKR012C 378 nt7.62□□□□□ -1.19
YAR028WP39548 YKR023WYKR023W 1593 nt7.62□□□□□ -1.19
YAR028WP39548 NEM1YHR004C 1341 nt7.61□□□□□ -1.19
YAR028WP39548 TIF3YPR163C 1311 nt7.61□□□□□ -1.19
YAR028WP39548 YLR283WYLR283W 945 nt7.61□□□□□ -1.19
YAR028WP39548 SDS24YBR214W 1584 nt7.6□□□□□ -1.19
YAR028WP39548 YJR056CYJR056C 711 nt7.6□□□□□ -1.19
YAR028WP39548 RSM7YJR113C 744 nt7.6□□□□□ -1.19
YAR028WP39548 YNL140CYNL140C 570 nt7.6□□□□□ -1.19
YAR028WP39548 GNP1YDR508C 1992 nt7.6□□□□□ -1.19
YAR028WP39548 VBA3YCL069W 1377 nt7.59□□□□□ -1.19
YAR028WP39548 MAF1YDR005C 1188 nt7.59□□□□□ -1.19
YAR028WP39548 MAD2YJL030W 591 nt7.59□□□□□ -1.19
YAR028WP39548 SLM3YDL033C 1254 nt7.58□□□□□ -1.2
YAR028WP39548 YDL157CYDL157C 357 nt7.58□□□□□ -1.2
YAR028WP39548 GLY1YEL046C 1164 nt7.58□□□□□ -1.2
YAR028WP39548 CDD1YLR245C 429 nt7.58□□□□□ -1.2
YAR028WP39548 AVO2YMR068W 1281 nt7.58□□□□□ -1.2
YAR028WP39548 FES1YBR101C 873 nt7.58□□□□□ -1.2
YAR028WP39548 PEX34YCL056C 435 nt7.58□□□□□ -1.2
YAR028WP39548 YBR138CYBR138C 1575 nt7.58□□□□□ -1.2
YAR028WP39548 INO1YJL153C 1602 nt7.57□□□□□ -1.2
YAR028WP39548 ISY1YJR050W 708 nt7.57□□□□□ -1.2
YAR028WP39548 DIA1YMR316W 1011 nt7.57□□□□□ -1.2
YAR028WP39548 LPD1YFL018C 1500 nt7.57□□□□□ -1.2
YAR028WP39548 MRN1YPL184C 1839 nt7.57□□□□□ -1.2
YAR028WP39548 PMT7YDR307W 1989 nt7.57□□□□□ -1.2
YAR028WP39548 CDC10YCR002C 969 nt7.56□□□□□ -1.2
YAR028WP39548 REV7YIL139C 738 nt7.56□□□□□ -1.2
YAR028WP39548 SEN2YLR105C 1134 nt7.56□□□□□ -1.2
YAR028WP39548 REX3YLR107W 1215 nt7.56□□□□□ -1.2
YAR028WP39548 TGL5YOR081C 2250 nt7.55□□□□□ -1.2
YAR028WP39548 SPR1YOR190W 1338 nt7.55□□□□□ -1.2
YAR028WP39548 MPS2YGL075C 1164 nt7.55□□□□□ -1.2
YAR028WP39548 INM1YHR046C 888 nt7.55□□□□□ -1.2
YAR028WP39548 NMD4YLR363C 657 nt7.55□□□□□ -1.2
YAR028WP39548 MSA2YKR077W 1092 nt7.54□□□□□ -1.2
YAR028WP39548 RSA3YLR221C 663 nt7.54□□□□□ -1.2
YAR028WP39548 VPS28YPL065W 729 nt7.54□□□□□ -1.2
YAR028WP39548 KTR3YBR205W 1215 nt7.54□□□□□ -1.2
YAR028WP39548 YFR020WYFR020W 699 nt7.53□□□□□ -1.2
YAR028WP39548 TDA4YJR116W 840 nt7.53□□□□□ -1.2
YAR028WP39548 LRO1YNR008W 1986 nt7.53□□□□□ -1.2
YAR028WP39548 SNU71YGR013W 1863 nt7.52□□□□□ -1.21
YAR028WP39548 EDC1YGL222C 528 nt7.52□□□□□ -1.21
YAR028WP39548 PHB2YGR231C 933 nt7.52□□□□□ -1.21
YAR028WP39548 ADH3YMR083W 1128 nt7.52□□□□□ -1.21
YAR028WP39548 ARR1YPR199C 885 nt7.52□□□□□ -1.21
YAR028WP39548 DIT1YDR403W 1611 nt7.52□□□□□ -1.21
YAR028WP39548 DIP5YPL265W 1827 nt7.51□□□□□ -1.21
YAR028WP39548 TRP1YDR007W 675 nt7.51□□□□□ -1.21
YAR028WP39548 MMS2YGL087C 414 nt7.51□□□□□ -1.21
YAR028WP39548 CPD1YGR247W 720 nt7.51□□□□□ -1.21
YAR028WP39548 YJR115WYJR115W 510 nt7.51□□□□□ -1.21
YAR028WP39548 NEJ1YLR265C 1029 nt7.51□□□□□ -1.21
YAR028WP39548 YET2YMR040W 483 nt7.51□□□□□ -1.21
YAR028WP39548 ENO1YGR254W 1314 nt7.51□□□□□ -1.21
YAR028WP39548 EHT1YBR177C 1356 nt7.5□□□□□ -1.21
YAR028WP39548 YEL034C-AYEL034C-A 603 nt7.5□□□□□ -1.21
YAR028WP39548 RPL2AYFR031C-A 765 nt7.5□□□□□ -1.21
YAR028WP39548 PEX22YAL055W 543 nt7.5□□□□□ -1.21
YAR028WP39548 YLR412C-AYLR412C-A 207 nt7.5□□□□□ -1.21
YAR028WP39548 RUF21RUF21 707 nt7.5□□□□□ -1.21
YAR028WP39548 STE4YOR212W 1272 nt7.5□□□□□ -1.21
YAR028WP39548 POS5YPL188W 1245 nt7.5□□□□□ -1.21
YAR028WP39548 INP54YOL065C 1155 nt7.49□□□□□ -1.21
YAR028WP39548 OST3YOR085W 1053 nt7.49□□□□□ -1.21
YAR028WP39548 MET13YGL125W 1803 nt7.48□□□□□ -1.21
YAR028WP39548 KTR4YBR199W 1395 nt7.47□□□□□ -1.21
YAR028WP39548 IGD1YFR017C 588 nt7.47□□□□□ -1.21
YAR028WP39548 RNA170RNA170 169 nt7.47□□□□□ -1.21
YAR028WP39548 WSC4YHL028W 1818 nt7.47□□□□□ -1.21
YAR028WP39548 ADD66YKL206C 804 nt7.46□□□□□ -1.22
YAR028WP39548 SRL2YLR082C 1179 nt7.46□□□□□ -1.22
YAR028WP39548 YLR349WYLR349W 507 nt7.46□□□□□ -1.22
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