Protein–RNA interactions for Protein: P33527

ABCC1, Multidrug resistance-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC1P33527 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
ABCC1P33527 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
ABCC1P33527 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
ABCC1P33527 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
ABCC1P33527 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
ABCC1P33527 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.09■■■■□ 3.85
ABCC1P33527 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC39.08■■■■□ 3.85
ABCC1P33527 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
ABCC1P33527 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
ABCC1P33527 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
ABCC1P33527 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
ABCC1P33527 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.07■■■■□ 3.84
ABCC1P33527 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC39.07■■■■□ 3.84
ABCC1P33527 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.07■■■■□ 3.84
ABCC1P33527 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC39.07■■■■□ 3.84
ABCC1P33527 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC39.07■■■■□ 3.84
ABCC1P33527 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC39.05■■■■□ 3.84
ABCC1P33527 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
ABCC1P33527 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
ABCC1P33527 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC39.03■■■■□ 3.84
ABCC1P33527 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
ABCC1P33527 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC39.03■■■■□ 3.84
ABCC1P33527 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC39.03■■■■□ 3.84
ABCC1P33527 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
ABCC1P33527 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC39.03■■■■□ 3.84
ABCC1P33527 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
ABCC1P33527 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
ABCC1P33527 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.02■■■■□ 3.84
ABCC1P33527 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC39.02■■■■□ 3.84
ABCC1P33527 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC39.01■■■■□ 3.84
ABCC1P33527 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC39.01■■■■□ 3.84
ABCC1P33527 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC39■■■■□ 3.83
ABCC1P33527 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC38.99■■■■□ 3.83
ABCC1P33527 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC38.98■■■■□ 3.83
ABCC1P33527 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
ABCC1P33527 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC38.98■■■■□ 3.83
ABCC1P33527 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.98■■■■□ 3.83
ABCC1P33527 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.97■■■■□ 3.83
ABCC1P33527 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC38.96■■■■□ 3.83
ABCC1P33527 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
ABCC1P33527 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
ABCC1P33527 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC38.95■■■■□ 3.83
ABCC1P33527 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
ABCC1P33527 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
ABCC1P33527 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC38.94■■■■□ 3.82
ABCC1P33527 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC38.93■■■■□ 3.82
ABCC1P33527 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
ABCC1P33527 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC38.93■■■■□ 3.82
ABCC1P33527 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC38.93■■■■□ 3.82
ABCC1P33527 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC38.92■■■■□ 3.82
ABCC1P33527 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
ABCC1P33527 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
ABCC1P33527 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC38.91■■■■□ 3.82
ABCC1P33527 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
ABCC1P33527 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
ABCC1P33527 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
ABCC1P33527 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
ABCC1P33527 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
ABCC1P33527 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
ABCC1P33527 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
ABCC1P33527 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC38.88■■■■□ 3.81
ABCC1P33527 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
ABCC1P33527 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
ABCC1P33527 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
ABCC1P33527 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC38.85■■■■□ 3.81
ABCC1P33527 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
ABCC1P33527 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC38.84■■■■□ 3.81
ABCC1P33527 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
ABCC1P33527 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
ABCC1P33527 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC38.83■■■■□ 3.81
ABCC1P33527 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC38.83■■■■□ 3.81
ABCC1P33527 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
ABCC1P33527 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
ABCC1P33527 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC38.81■■■■□ 3.8
ABCC1P33527 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
ABCC1P33527 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
ABCC1P33527 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
ABCC1P33527 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.79■■■■□ 3.8
ABCC1P33527 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC38.78■■■■□ 3.8
ABCC1P33527 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC38.78■■■■□ 3.8
ABCC1P33527 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
ABCC1P33527 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
ABCC1P33527 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
ABCC1P33527 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC38.76■■■■□ 3.8
ABCC1P33527 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
ABCC1P33527 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
ABCC1P33527 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
ABCC1P33527 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC38.74■■■■□ 3.79
ABCC1P33527 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC38.74■■■■□ 3.79
ABCC1P33527 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
ABCC1P33527 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
ABCC1P33527 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
ABCC1P33527 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
ABCC1P33527 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.72■■■■□ 3.79
ABCC1P33527 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.71■■■■□ 3.79
ABCC1P33527 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.7■■■■□ 3.79
ABCC1P33527 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC38.69■■■■□ 3.78
ABCC1P33527 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC38.69■■■■□ 3.78
ABCC1P33527 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC38.69■■■■□ 3.78
ABCC1P33527 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC38.69■■■■□ 3.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms