Protein–RNA interactions for Protein: P31941

APOBEC3A, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3AP31941 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOBEC3AP31941 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOBEC3AP31941 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
APOBEC3AP31941 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOBEC3AP31941 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOBEC3AP31941 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
APOBEC3AP31941 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOBEC3AP31941 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOBEC3AP31941 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOBEC3AP31941 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOBEC3AP31941 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOBEC3AP31941 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOBEC3AP31941 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOBEC3AP31941 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOBEC3AP31941 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOBEC3AP31941 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
APOBEC3AP31941 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
APOBEC3AP31941 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
APOBEC3AP31941 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
APOBEC3AP31941 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOBEC3AP31941 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOBEC3AP31941 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOBEC3AP31941 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
APOBEC3AP31941 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOBEC3AP31941 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOBEC3AP31941 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOBEC3AP31941 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOBEC3AP31941 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOBEC3AP31941 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOBEC3AP31941 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOBEC3AP31941 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOBEC3AP31941 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOBEC3AP31941 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
APOBEC3AP31941 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
APOBEC3AP31941 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOBEC3AP31941 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOBEC3AP31941 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
APOBEC3AP31941 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOBEC3AP31941 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOBEC3AP31941 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOBEC3AP31941 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOBEC3AP31941 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOBEC3AP31941 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
APOBEC3AP31941 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
APOBEC3AP31941 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOBEC3AP31941 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
APOBEC3AP31941 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOBEC3AP31941 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOBEC3AP31941 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOBEC3AP31941 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOBEC3AP31941 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOBEC3AP31941 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOBEC3AP31941 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOBEC3AP31941 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOBEC3AP31941 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOBEC3AP31941 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOBEC3AP31941 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOBEC3AP31941 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOBEC3AP31941 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOBEC3AP31941 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOBEC3AP31941 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOBEC3AP31941 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOBEC3AP31941 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOBEC3AP31941 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOBEC3AP31941 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOBEC3AP31941 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOBEC3AP31941 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOBEC3AP31941 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOBEC3AP31941 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOBEC3AP31941 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOBEC3AP31941 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOBEC3AP31941 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOBEC3AP31941 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOBEC3AP31941 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOBEC3AP31941 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOBEC3AP31941 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOBEC3AP31941 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOBEC3AP31941 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOBEC3AP31941 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOBEC3AP31941 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOBEC3AP31941 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOBEC3AP31941 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOBEC3AP31941 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOBEC3AP31941 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOBEC3AP31941 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOBEC3AP31941 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOBEC3AP31941 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOBEC3AP31941 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
APOBEC3AP31941 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOBEC3AP31941 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOBEC3AP31941 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOBEC3AP31941 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOBEC3AP31941 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOBEC3AP31941 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOBEC3AP31941 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
APOBEC3AP31941 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOBEC3AP31941 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOBEC3AP31941 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
APOBEC3AP31941 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
APOBEC3AP31941 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms