Protein–RNA interactions for Protein: P30876

POLR2B, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2BP30876 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
POLR2BP30876 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
POLR2BP30876 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
POLR2BP30876 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
POLR2BP30876 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
POLR2BP30876 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
POLR2BP30876 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
POLR2BP30876 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
POLR2BP30876 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
POLR2BP30876 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
POLR2BP30876 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
POLR2BP30876 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
POLR2BP30876 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
POLR2BP30876 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
POLR2BP30876 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
POLR2BP30876 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
POLR2BP30876 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
POLR2BP30876 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
POLR2BP30876 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
POLR2BP30876 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
POLR2BP30876 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
POLR2BP30876 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
POLR2BP30876 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
POLR2BP30876 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
POLR2BP30876 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
POLR2BP30876 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
POLR2BP30876 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
POLR2BP30876 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
POLR2BP30876 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
POLR2BP30876 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
POLR2BP30876 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
POLR2BP30876 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
POLR2BP30876 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
POLR2BP30876 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
POLR2BP30876 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
POLR2BP30876 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
POLR2BP30876 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
POLR2BP30876 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
POLR2BP30876 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
POLR2BP30876 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
POLR2BP30876 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
POLR2BP30876 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
POLR2BP30876 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
POLR2BP30876 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
POLR2BP30876 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
POLR2BP30876 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
POLR2BP30876 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
POLR2BP30876 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
POLR2BP30876 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
POLR2BP30876 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
POLR2BP30876 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
POLR2BP30876 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
POLR2BP30876 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
POLR2BP30876 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
POLR2BP30876 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
POLR2BP30876 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
POLR2BP30876 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
POLR2BP30876 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
POLR2BP30876 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
POLR2BP30876 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
POLR2BP30876 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
POLR2BP30876 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
POLR2BP30876 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
POLR2BP30876 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
POLR2BP30876 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
POLR2BP30876 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
POLR2BP30876 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
POLR2BP30876 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
POLR2BP30876 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
POLR2BP30876 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
POLR2BP30876 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
POLR2BP30876 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
POLR2BP30876 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
POLR2BP30876 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
POLR2BP30876 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
POLR2BP30876 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
POLR2BP30876 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
POLR2BP30876 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
POLR2BP30876 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
POLR2BP30876 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
POLR2BP30876 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
POLR2BP30876 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
POLR2BP30876 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
POLR2BP30876 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
POLR2BP30876 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
POLR2BP30876 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
POLR2BP30876 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
POLR2BP30876 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
POLR2BP30876 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
POLR2BP30876 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
POLR2BP30876 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
POLR2BP30876 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
POLR2BP30876 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
POLR2BP30876 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
POLR2BP30876 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
POLR2BP30876 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
POLR2BP30876 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
POLR2BP30876 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
POLR2BP30876 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
POLR2BP30876 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms