Protein–RNA interactions for Protein: P29279

CTGF, Connective tissue growth factor, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTGFP29279 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CTGFP29279 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CTGFP29279 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CTGFP29279 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CTGFP29279 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CTGFP29279 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CTGFP29279 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
CTGFP29279 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CTGFP29279 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CTGFP29279 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CTGFP29279 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CTGFP29279 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CTGFP29279 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CTGFP29279 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CTGFP29279 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CTGFP29279 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CTGFP29279 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CTGFP29279 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CTGFP29279 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CTGFP29279 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CTGFP29279 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CTGFP29279 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CTGFP29279 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CTGFP29279 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CTGFP29279 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
CTGFP29279 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CTGFP29279 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CTGFP29279 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CTGFP29279 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CTGFP29279 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CTGFP29279 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CTGFP29279 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CTGFP29279 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CTGFP29279 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CTGFP29279 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CTGFP29279 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CTGFP29279 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CTGFP29279 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CTGFP29279 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
CTGFP29279 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CTGFP29279 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CTGFP29279 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CTGFP29279 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CTGFP29279 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
CTGFP29279 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CTGFP29279 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CTGFP29279 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CTGFP29279 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CTGFP29279 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
CTGFP29279 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CTGFP29279 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CTGFP29279 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
CTGFP29279 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CTGFP29279 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CTGFP29279 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CTGFP29279 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CTGFP29279 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CTGFP29279 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
CTGFP29279 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CTGFP29279 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CTGFP29279 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CTGFP29279 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CTGFP29279 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CTGFP29279 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CTGFP29279 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
CTGFP29279 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CTGFP29279 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CTGFP29279 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CTGFP29279 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CTGFP29279 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CTGFP29279 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CTGFP29279 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CTGFP29279 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CTGFP29279 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
CTGFP29279 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CTGFP29279 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CTGFP29279 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CTGFP29279 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CTGFP29279 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
CTGFP29279 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CTGFP29279 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CTGFP29279 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
CTGFP29279 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CTGFP29279 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CTGFP29279 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CTGFP29279 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CTGFP29279 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CTGFP29279 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CTGFP29279 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CTGFP29279 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CTGFP29279 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CTGFP29279 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CTGFP29279 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CTGFP29279 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
CTGFP29279 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CTGFP29279 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CTGFP29279 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CTGFP29279 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CTGFP29279 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
CTGFP29279 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms