Protein–RNA interactions for Protein: P28715

ERCC5, DNA repair protein complementing XP-G cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC5P28715 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ERCC5P28715 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ERCC5P28715 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ERCC5P28715 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ERCC5P28715 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ERCC5P28715 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ERCC5P28715 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
ERCC5P28715 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ERCC5P28715 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
ERCC5P28715 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ERCC5P28715 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ERCC5P28715 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ERCC5P28715 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ERCC5P28715 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ERCC5P28715 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ERCC5P28715 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ERCC5P28715 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ERCC5P28715 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ERCC5P28715 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ERCC5P28715 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ERCC5P28715 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
ERCC5P28715 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ERCC5P28715 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ERCC5P28715 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ERCC5P28715 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ERCC5P28715 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ERCC5P28715 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ERCC5P28715 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ERCC5P28715 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ERCC5P28715 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
ERCC5P28715 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ERCC5P28715 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
ERCC5P28715 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ERCC5P28715 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ERCC5P28715 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ERCC5P28715 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ERCC5P28715 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ERCC5P28715 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ERCC5P28715 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ERCC5P28715 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
ERCC5P28715 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ERCC5P28715 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ERCC5P28715 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ERCC5P28715 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ERCC5P28715 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
ERCC5P28715 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ERCC5P28715 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ERCC5P28715 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ERCC5P28715 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ERCC5P28715 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ERCC5P28715 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ERCC5P28715 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ERCC5P28715 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ERCC5P28715 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ERCC5P28715 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ERCC5P28715 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ERCC5P28715 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ERCC5P28715 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ERCC5P28715 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ERCC5P28715 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ERCC5P28715 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28■■■□□ 2.07
ERCC5P28715 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ERCC5P28715 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ERCC5P28715 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
ERCC5P28715 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ERCC5P28715 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ERCC5P28715 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ERCC5P28715 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ERCC5P28715 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ERCC5P28715 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ERCC5P28715 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
ERCC5P28715 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
ERCC5P28715 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ERCC5P28715 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ERCC5P28715 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ERCC5P28715 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ERCC5P28715 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ERCC5P28715 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ERCC5P28715 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ERCC5P28715 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ERCC5P28715 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ERCC5P28715 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ERCC5P28715 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ERCC5P28715 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ERCC5P28715 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ERCC5P28715 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ERCC5P28715 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ERCC5P28715 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ERCC5P28715 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ERCC5P28715 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ERCC5P28715 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ERCC5P28715 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ERCC5P28715 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ERCC5P28715 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
ERCC5P28715 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
ERCC5P28715 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
ERCC5P28715 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
ERCC5P28715 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
ERCC5P28715 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ERCC5P28715 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74 ms