Protein–RNA interactions for Protein: P25205

MCM3, DNA replication licensing factor MCM3, humanhuman

Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM3P25205 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MCM3P25205 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
MCM3P25205 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MCM3P25205 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MCM3P25205 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MCM3P25205 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MCM3P25205 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MCM3P25205 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MCM3P25205 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MCM3P25205 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MCM3P25205 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MCM3P25205 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MCM3P25205 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MCM3P25205 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MCM3P25205 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MCM3P25205 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MCM3P25205 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MCM3P25205 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MCM3P25205 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MCM3P25205 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MCM3P25205 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MCM3P25205 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MCM3P25205 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
MCM3P25205 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MCM3P25205 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MCM3P25205 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MCM3P25205 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MCM3P25205 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MCM3P25205 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MCM3P25205 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MCM3P25205 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MCM3P25205 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
MCM3P25205 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MCM3P25205 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
MCM3P25205 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MCM3P25205 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
MCM3P25205 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
MCM3P25205 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MCM3P25205 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MCM3P25205 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MCM3P25205 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MCM3P25205 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MCM3P25205 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MCM3P25205 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MCM3P25205 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
MCM3P25205 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
MCM3P25205 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MCM3P25205 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MCM3P25205 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MCM3P25205 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MCM3P25205 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MCM3P25205 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MCM3P25205 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MCM3P25205 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MCM3P25205 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MCM3P25205 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MCM3P25205 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MCM3P25205 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MCM3P25205 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MCM3P25205 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MCM3P25205 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MCM3P25205 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MCM3P25205 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MCM3P25205 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MCM3P25205 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MCM3P25205 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
MCM3P25205 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MCM3P25205 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MCM3P25205 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
MCM3P25205 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MCM3P25205 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MCM3P25205 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MCM3P25205 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MCM3P25205 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MCM3P25205 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MCM3P25205 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MCM3P25205 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MCM3P25205 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MCM3P25205 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MCM3P25205 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
MCM3P25205 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MCM3P25205 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MCM3P25205 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MCM3P25205 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MCM3P25205 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MCM3P25205 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MCM3P25205 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MCM3P25205 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MCM3P25205 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MCM3P25205 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MCM3P25205 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MCM3P25205 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MCM3P25205 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MCM3P25205 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MCM3P25205 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MCM3P25205 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MCM3P25205 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MCM3P25205 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MCM3P25205 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MCM3P25205 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms