Protein–RNA interactions for Protein: P17600

SYN1, Synapsin-1, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYN1P17600 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SYN1P17600 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SYN1P17600 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
SYN1P17600 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SYN1P17600 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SYN1P17600 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SYN1P17600 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SYN1P17600 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SYN1P17600 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SYN1P17600 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SYN1P17600 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SYN1P17600 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SYN1P17600 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
SYN1P17600 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
SYN1P17600 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SYN1P17600 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SYN1P17600 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SYN1P17600 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SYN1P17600 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SYN1P17600 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
SYN1P17600 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SYN1P17600 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SYN1P17600 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SYN1P17600 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SYN1P17600 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SYN1P17600 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SYN1P17600 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SYN1P17600 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SYN1P17600 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SYN1P17600 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SYN1P17600 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
SYN1P17600 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SYN1P17600 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SYN1P17600 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SYN1P17600 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SYN1P17600 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SYN1P17600 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SYN1P17600 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SYN1P17600 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SYN1P17600 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SYN1P17600 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SYN1P17600 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SYN1P17600 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SYN1P17600 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
SYN1P17600 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SYN1P17600 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SYN1P17600 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SYN1P17600 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
SYN1P17600 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
SYN1P17600 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
SYN1P17600 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SYN1P17600 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SYN1P17600 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
SYN1P17600 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SYN1P17600 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
SYN1P17600 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SYN1P17600 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SYN1P17600 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SYN1P17600 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
SYN1P17600 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SYN1P17600 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SYN1P17600 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SYN1P17600 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SYN1P17600 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
SYN1P17600 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SYN1P17600 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SYN1P17600 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SYN1P17600 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SYN1P17600 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SYN1P17600 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SYN1P17600 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
SYN1P17600 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SYN1P17600 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SYN1P17600 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SYN1P17600 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SYN1P17600 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SYN1P17600 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
SYN1P17600 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
SYN1P17600 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SYN1P17600 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SYN1P17600 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
SYN1P17600 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SYN1P17600 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SYN1P17600 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SYN1P17600 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SYN1P17600 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SYN1P17600 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SYN1P17600 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SYN1P17600 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SYN1P17600 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
SYN1P17600 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SYN1P17600 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SYN1P17600 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SYN1P17600 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SYN1P17600 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SYN1P17600 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SYN1P17600 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SYN1P17600 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
SYN1P17600 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SYN1P17600 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 156.6 ms