Protein–RNA interactions for Protein: P14678

SNRPB, Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B', humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPBP14678 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNRPBP14678 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNRPBP14678 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNRPBP14678 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNRPBP14678 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SNRPBP14678 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNRPBP14678 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNRPBP14678 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNRPBP14678 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNRPBP14678 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNRPBP14678 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SNRPBP14678 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNRPBP14678 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNRPBP14678 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNRPBP14678 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNRPBP14678 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNRPBP14678 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SNRPBP14678 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNRPBP14678 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNRPBP14678 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNRPBP14678 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNRPBP14678 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNRPBP14678 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNRPBP14678 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNRPBP14678 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNRPBP14678 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNRPBP14678 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNRPBP14678 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNRPBP14678 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNRPBP14678 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNRPBP14678 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNRPBP14678 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNRPBP14678 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNRPBP14678 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNRPBP14678 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNRPBP14678 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNRPBP14678 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNRPBP14678 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNRPBP14678 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNRPBP14678 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNRPBP14678 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNRPBP14678 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SNRPBP14678 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNRPBP14678 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNRPBP14678 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNRPBP14678 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNRPBP14678 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNRPBP14678 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNRPBP14678 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNRPBP14678 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNRPBP14678 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNRPBP14678 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNRPBP14678 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNRPBP14678 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNRPBP14678 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SNRPBP14678 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SNRPBP14678 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNRPBP14678 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNRPBP14678 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNRPBP14678 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNRPBP14678 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNRPBP14678 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNRPBP14678 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNRPBP14678 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNRPBP14678 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNRPBP14678 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNRPBP14678 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNRPBP14678 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNRPBP14678 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNRPBP14678 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNRPBP14678 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNRPBP14678 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNRPBP14678 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNRPBP14678 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNRPBP14678 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SNRPBP14678 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNRPBP14678 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNRPBP14678 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNRPBP14678 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNRPBP14678 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNRPBP14678 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNRPBP14678 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNRPBP14678 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNRPBP14678 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNRPBP14678 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNRPBP14678 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNRPBP14678 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNRPBP14678 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNRPBP14678 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNRPBP14678 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNRPBP14678 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNRPBP14678 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNRPBP14678 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SNRPBP14678 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNRPBP14678 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNRPBP14678 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNRPBP14678 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNRPBP14678 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNRPBP14678 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNRPBP14678 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.6 ms