Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC45.6■■■■■ 4.89
TOP2AP11388 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC45.59■■■■■ 4.89
TOP2AP11388 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.59■■■■■ 4.89
TOP2AP11388 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC45.58■■■■■ 4.89
TOP2AP11388 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.57■■■■■ 4.89
TOP2AP11388 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.56■■■■■ 4.88
TOP2AP11388 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.55■■■■■ 4.88
TOP2AP11388 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.54■■■■■ 4.88
TOP2AP11388 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC45.54■■■■■ 4.88
TOP2AP11388 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC45.54■■■■■ 4.88
TOP2AP11388 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC45.54■■■■■ 4.88
TOP2AP11388 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC45.53■■■■■ 4.88
TOP2AP11388 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC45.52■■■■■ 4.88
TOP2AP11388 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.52■■■■■ 4.88
TOP2AP11388 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC45.52■■■■■ 4.88
TOP2AP11388 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC45.52■■■■■ 4.88
TOP2AP11388 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.52■■■■■ 4.88
TOP2AP11388 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.51■■■■■ 4.88
TOP2AP11388 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC45.51■■■■■ 4.88
TOP2AP11388 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC45.51■■■■■ 4.88
TOP2AP11388 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC45.51■■■■■ 4.88
TOP2AP11388 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC45.5■■■■■ 4.87
TOP2AP11388 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC45.5■■■■■ 4.87
TOP2AP11388 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC45.49■■■■■ 4.87
TOP2AP11388 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC45.49■■■■■ 4.87
TOP2AP11388 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC45.48■■■■■ 4.87
TOP2AP11388 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC45.47■■■■■ 4.87
TOP2AP11388 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC45.47■■■■■ 4.87
TOP2AP11388 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.47■■■■■ 4.87
TOP2AP11388 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.46■■■■■ 4.87
TOP2AP11388 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.45■■■■■ 4.87
TOP2AP11388 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC45.44■■■■■ 4.86
TOP2AP11388 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.44■■■■■ 4.86
TOP2AP11388 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.43■■■■■ 4.86
TOP2AP11388 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC45.43■■■■■ 4.86
TOP2AP11388 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC45.43■■■■■ 4.86
TOP2AP11388 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.42■■■■■ 4.86
TOP2AP11388 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC45.42■■■■■ 4.86
TOP2AP11388 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC45.4■■■■■ 4.86
TOP2AP11388 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.4■■■■■ 4.86
TOP2AP11388 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC45.4■■■■■ 4.86
TOP2AP11388 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.39■■■■■ 4.86
TOP2AP11388 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.39■■■■■ 4.86
TOP2AP11388 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.38■■■■■ 4.86
TOP2AP11388 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.38■■■■■ 4.86
TOP2AP11388 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.38■■■■■ 4.85
TOP2AP11388 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.37■■■■■ 4.85
TOP2AP11388 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.37■■■■■ 4.85
TOP2AP11388 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC45.36■■■■■ 4.85
TOP2AP11388 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.36■■■■■ 4.85
TOP2AP11388 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.36■■■■■ 4.85
TOP2AP11388 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.35■■■■■ 4.85
TOP2AP11388 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC45.35■■■■■ 4.85
TOP2AP11388 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC45.34■■■■■ 4.85
TOP2AP11388 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC45.34■■■■■ 4.85
TOP2AP11388 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC45.34■■■■■ 4.85
TOP2AP11388 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC45.33■■■■■ 4.85
TOP2AP11388 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.33■■■■■ 4.85
TOP2AP11388 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.33■■■■■ 4.85
TOP2AP11388 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.33■■■■■ 4.85
TOP2AP11388 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.33■■■■■ 4.85
TOP2AP11388 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.32■■■■■ 4.85
TOP2AP11388 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.32■■■■■ 4.85
TOP2AP11388 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.32■■■■■ 4.85
TOP2AP11388 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC45.32■■■■■ 4.85
TOP2AP11388 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC45.31■■■■■ 4.84
TOP2AP11388 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.31■■■■■ 4.84
TOP2AP11388 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC45.31■■■■■ 4.84
TOP2AP11388 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC45.31■■■■■ 4.84
TOP2AP11388 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC45.31■■■■■ 4.84
TOP2AP11388 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.31■■■■■ 4.84
TOP2AP11388 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC45.3■■■■■ 4.84
TOP2AP11388 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC45.29■■■■■ 4.84
TOP2AP11388 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC45.27■■■■■ 4.84
TOP2AP11388 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.27■■■■■ 4.84
TOP2AP11388 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.27■■■■■ 4.84
TOP2AP11388 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.26■■■■■ 4.84
TOP2AP11388 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC45.25■■■■■ 4.83
TOP2AP11388 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC45.25■■■■■ 4.83
TOP2AP11388 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.23■■■■■ 4.83
TOP2AP11388 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.23■■■■■ 4.83
TOP2AP11388 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC45.23■■■■■ 4.83
TOP2AP11388 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC45.22■■■■■ 4.83
TOP2AP11388 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.22■■■■■ 4.83
TOP2AP11388 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.22■■■■■ 4.83
TOP2AP11388 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.22■■■■■ 4.83
TOP2AP11388 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC45.21■■■■■ 4.83
TOP2AP11388 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC45.21■■■■■ 4.83
TOP2AP11388 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC45.2■■■■■ 4.83
TOP2AP11388 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC45.2■■■■■ 4.83
TOP2AP11388 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC45.18■■■■■ 4.82
TOP2AP11388 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC45.18■■■■■ 4.82
TOP2AP11388 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.18■■■■■ 4.82
TOP2AP11388 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC45.17■■■■■ 4.82
TOP2AP11388 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC45.16■■■■■ 4.82
TOP2AP11388 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC45.16■■■■■ 4.82
TOP2AP11388 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC45.16■■■■■ 4.82
TOP2AP11388 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC45.15■■■■■ 4.82
TOP2AP11388 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.15■■■■■ 4.82
TOP2AP11388 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC45.15■■■■■ 4.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms