Protein–RNA interactions for Protein: P0DN78

OPN1MW3, Medium-wave-sensitive opsin 3, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN1MW3P0DN78 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
OPN1MW3P0DN78 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
OPN1MW3P0DN78 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
OPN1MW3P0DN78 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
OPN1MW3P0DN78 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
OPN1MW3P0DN78 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
OPN1MW3P0DN78 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
OPN1MW3P0DN78 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
OPN1MW3P0DN78 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
OPN1MW3P0DN78 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
OPN1MW3P0DN78 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
OPN1MW3P0DN78 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
OPN1MW3P0DN78 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
OPN1MW3P0DN78 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
OPN1MW3P0DN78 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
OPN1MW3P0DN78 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
OPN1MW3P0DN78 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
OPN1MW3P0DN78 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
OPN1MW3P0DN78 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
OPN1MW3P0DN78 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
OPN1MW3P0DN78 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
OPN1MW3P0DN78 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
OPN1MW3P0DN78 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
OPN1MW3P0DN78 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
OPN1MW3P0DN78 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
OPN1MW3P0DN78 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
OPN1MW3P0DN78 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
OPN1MW3P0DN78 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
OPN1MW3P0DN78 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
OPN1MW3P0DN78 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
OPN1MW3P0DN78 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
OPN1MW3P0DN78 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
OPN1MW3P0DN78 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
OPN1MW3P0DN78 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
OPN1MW3P0DN78 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
OPN1MW3P0DN78 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
OPN1MW3P0DN78 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
OPN1MW3P0DN78 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
OPN1MW3P0DN78 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
OPN1MW3P0DN78 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
OPN1MW3P0DN78 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
OPN1MW3P0DN78 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
OPN1MW3P0DN78 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
OPN1MW3P0DN78 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
OPN1MW3P0DN78 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
OPN1MW3P0DN78 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
OPN1MW3P0DN78 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
OPN1MW3P0DN78 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
OPN1MW3P0DN78 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
OPN1MW3P0DN78 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
OPN1MW3P0DN78 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
OPN1MW3P0DN78 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
OPN1MW3P0DN78 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
OPN1MW3P0DN78 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
OPN1MW3P0DN78 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
OPN1MW3P0DN78 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
OPN1MW3P0DN78 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
OPN1MW3P0DN78 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
OPN1MW3P0DN78 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
OPN1MW3P0DN78 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
OPN1MW3P0DN78 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
OPN1MW3P0DN78 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
OPN1MW3P0DN78 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
OPN1MW3P0DN78 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
OPN1MW3P0DN78 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
OPN1MW3P0DN78 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
OPN1MW3P0DN78 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
OPN1MW3P0DN78 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
OPN1MW3P0DN78 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
OPN1MW3P0DN78 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
OPN1MW3P0DN78 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
OPN1MW3P0DN78 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
OPN1MW3P0DN78 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
OPN1MW3P0DN78 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
OPN1MW3P0DN78 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
OPN1MW3P0DN78 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
OPN1MW3P0DN78 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
OPN1MW3P0DN78 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
OPN1MW3P0DN78 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
OPN1MW3P0DN78 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
OPN1MW3P0DN78 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
OPN1MW3P0DN78 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
OPN1MW3P0DN78 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
OPN1MW3P0DN78 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
OPN1MW3P0DN78 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
OPN1MW3P0DN78 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
OPN1MW3P0DN78 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
OPN1MW3P0DN78 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
OPN1MW3P0DN78 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
OPN1MW3P0DN78 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
OPN1MW3P0DN78 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
OPN1MW3P0DN78 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
OPN1MW3P0DN78 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
OPN1MW3P0DN78 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
OPN1MW3P0DN78 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
OPN1MW3P0DN78 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
OPN1MW3P0DN78 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
OPN1MW3P0DN78 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
OPN1MW3P0DN78 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
OPN1MW3P0DN78 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms