Protein–RNA interactions for Protein: P0DKX4

SMIM18, Small integral membrane protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM18P0DKX4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SMIM18P0DKX4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMIM18P0DKX4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMIM18P0DKX4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMIM18P0DKX4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMIM18P0DKX4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMIM18P0DKX4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMIM18P0DKX4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMIM18P0DKX4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMIM18P0DKX4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMIM18P0DKX4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMIM18P0DKX4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMIM18P0DKX4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMIM18P0DKX4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMIM18P0DKX4 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMIM18P0DKX4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMIM18P0DKX4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMIM18P0DKX4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMIM18P0DKX4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMIM18P0DKX4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMIM18P0DKX4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMIM18P0DKX4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMIM18P0DKX4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMIM18P0DKX4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SMIM18P0DKX4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SMIM18P0DKX4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SMIM18P0DKX4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMIM18P0DKX4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMIM18P0DKX4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMIM18P0DKX4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMIM18P0DKX4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMIM18P0DKX4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMIM18P0DKX4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMIM18P0DKX4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMIM18P0DKX4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMIM18P0DKX4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMIM18P0DKX4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMIM18P0DKX4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMIM18P0DKX4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMIM18P0DKX4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMIM18P0DKX4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMIM18P0DKX4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMIM18P0DKX4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMIM18P0DKX4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMIM18P0DKX4 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMIM18P0DKX4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMIM18P0DKX4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMIM18P0DKX4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMIM18P0DKX4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMIM18P0DKX4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMIM18P0DKX4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMIM18P0DKX4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMIM18P0DKX4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMIM18P0DKX4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMIM18P0DKX4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMIM18P0DKX4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMIM18P0DKX4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMIM18P0DKX4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMIM18P0DKX4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMIM18P0DKX4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SMIM18P0DKX4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMIM18P0DKX4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMIM18P0DKX4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SMIM18P0DKX4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMIM18P0DKX4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMIM18P0DKX4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMIM18P0DKX4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMIM18P0DKX4 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMIM18P0DKX4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMIM18P0DKX4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMIM18P0DKX4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMIM18P0DKX4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMIM18P0DKX4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SMIM18P0DKX4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMIM18P0DKX4 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMIM18P0DKX4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMIM18P0DKX4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMIM18P0DKX4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SMIM18P0DKX4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMIM18P0DKX4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMIM18P0DKX4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMIM18P0DKX4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMIM18P0DKX4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SMIM18P0DKX4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMIM18P0DKX4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMIM18P0DKX4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMIM18P0DKX4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMIM18P0DKX4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMIM18P0DKX4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMIM18P0DKX4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMIM18P0DKX4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMIM18P0DKX4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMIM18P0DKX4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMIM18P0DKX4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMIM18P0DKX4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMIM18P0DKX4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMIM18P0DKX4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMIM18P0DKX4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMIM18P0DKX4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMIM18P0DKX4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms