Protein–RNA interactions for Protein: P04436

T-cell receptor alpha chain V region HPB-MLT (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04436 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
P04436 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
P04436 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
P04436 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
P04436 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
P04436 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
P04436 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
P04436 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
P04436 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
P04436 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
P04436 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
P04436 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
P04436 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
P04436 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
P04436 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
P04436 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
P04436 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
P04436 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
P04436 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
P04436 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
P04436 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
P04436 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
P04436 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
P04436 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
P04436 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
P04436 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
P04436 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
P04436 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
P04436 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
P04436 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
P04436 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
P04436 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
P04436 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
P04436 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
P04436 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
P04436 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
P04436 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
P04436 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
P04436 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
P04436 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
P04436 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
P04436 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
P04436 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
P04436 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
P04436 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
P04436 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
P04436 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
P04436 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
P04436 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
P04436 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
P04436 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
P04436 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
P04436 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
P04436 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
P04436 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
P04436 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
P04436 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
P04436 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
P04436 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
P04436 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
P04436 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
P04436 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
P04436 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
P04436 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
P04436 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
P04436 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
P04436 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
P04436 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
P04436 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
P04436 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
P04436 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
P04436 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
P04436 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
P04436 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
P04436 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
P04436 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
P04436 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
P04436 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
P04436 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
P04436 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
P04436 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
P04436 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
P04436 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
P04436 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
P04436 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
P04436 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
P04436 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
P04436 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
P04436 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
P04436 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
P04436 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
P04436 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
P04436 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
P04436 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
P04436 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
P04436 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
P04436 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
P04436 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
P04436 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
P04436 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms