Protein–RNA interactions for Protein: O95931

CBX7, Chromobox protein homolog 7, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX7O95931 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CBX7O95931 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CBX7O95931 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CBX7O95931 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CBX7O95931 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CBX7O95931 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CBX7O95931 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CBX7O95931 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CBX7O95931 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CBX7O95931 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CBX7O95931 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CBX7O95931 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CBX7O95931 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CBX7O95931 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CBX7O95931 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CBX7O95931 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CBX7O95931 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CBX7O95931 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CBX7O95931 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CBX7O95931 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CBX7O95931 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CBX7O95931 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CBX7O95931 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CBX7O95931 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CBX7O95931 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CBX7O95931 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CBX7O95931 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CBX7O95931 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CBX7O95931 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CBX7O95931 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CBX7O95931 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CBX7O95931 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CBX7O95931 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CBX7O95931 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CBX7O95931 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CBX7O95931 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CBX7O95931 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CBX7O95931 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CBX7O95931 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CBX7O95931 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CBX7O95931 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CBX7O95931 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CBX7O95931 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CBX7O95931 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CBX7O95931 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CBX7O95931 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CBX7O95931 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CBX7O95931 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CBX7O95931 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CBX7O95931 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CBX7O95931 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CBX7O95931 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CBX7O95931 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CBX7O95931 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CBX7O95931 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CBX7O95931 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CBX7O95931 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CBX7O95931 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CBX7O95931 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CBX7O95931 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CBX7O95931 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CBX7O95931 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CBX7O95931 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CBX7O95931 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CBX7O95931 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CBX7O95931 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CBX7O95931 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CBX7O95931 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CBX7O95931 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CBX7O95931 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CBX7O95931 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CBX7O95931 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CBX7O95931 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CBX7O95931 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CBX7O95931 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CBX7O95931 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CBX7O95931 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CBX7O95931 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CBX7O95931 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CBX7O95931 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CBX7O95931 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CBX7O95931 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CBX7O95931 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CBX7O95931 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CBX7O95931 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CBX7O95931 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CBX7O95931 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CBX7O95931 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CBX7O95931 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CBX7O95931 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CBX7O95931 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CBX7O95931 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CBX7O95931 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CBX7O95931 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CBX7O95931 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CBX7O95931 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CBX7O95931 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CBX7O95931 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CBX7O95931 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CBX7O95931 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.3 ms