Protein–RNA interactions for Protein: O95342

ABCB11, Bile salt export pump, humanhuman

Predictions only

Length 1,321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB11O95342 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ABCB11O95342 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ABCB11O95342 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ABCB11O95342 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ABCB11O95342 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
ABCB11O95342 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ABCB11O95342 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
ABCB11O95342 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ABCB11O95342 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ABCB11O95342 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ABCB11O95342 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ABCB11O95342 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ABCB11O95342 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ABCB11O95342 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ABCB11O95342 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ABCB11O95342 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ABCB11O95342 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ABCB11O95342 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ABCB11O95342 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ABCB11O95342 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ABCB11O95342 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ABCB11O95342 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ABCB11O95342 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
ABCB11O95342 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ABCB11O95342 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ABCB11O95342 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ABCB11O95342 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ABCB11O95342 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ABCB11O95342 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ABCB11O95342 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ABCB11O95342 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ABCB11O95342 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ABCB11O95342 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ABCB11O95342 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ABCB11O95342 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ABCB11O95342 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ABCB11O95342 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
ABCB11O95342 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ABCB11O95342 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ABCB11O95342 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ABCB11O95342 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ABCB11O95342 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ABCB11O95342 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ABCB11O95342 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ABCB11O95342 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ABCB11O95342 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ABCB11O95342 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ABCB11O95342 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ABCB11O95342 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ABCB11O95342 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ABCB11O95342 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
ABCB11O95342 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ABCB11O95342 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ABCB11O95342 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
ABCB11O95342 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ABCB11O95342 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ABCB11O95342 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ABCB11O95342 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ABCB11O95342 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ABCB11O95342 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ABCB11O95342 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ABCB11O95342 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ABCB11O95342 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ABCB11O95342 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ABCB11O95342 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ABCB11O95342 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
ABCB11O95342 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
ABCB11O95342 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
ABCB11O95342 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
ABCB11O95342 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ABCB11O95342 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ABCB11O95342 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ABCB11O95342 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ABCB11O95342 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ABCB11O95342 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ABCB11O95342 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ABCB11O95342 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ABCB11O95342 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ABCB11O95342 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ABCB11O95342 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ABCB11O95342 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ABCB11O95342 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ABCB11O95342 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ABCB11O95342 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ABCB11O95342 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ABCB11O95342 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ABCB11O95342 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ABCB11O95342 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ABCB11O95342 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
ABCB11O95342 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ABCB11O95342 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ABCB11O95342 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
ABCB11O95342 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ABCB11O95342 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ABCB11O95342 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ABCB11O95342 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ABCB11O95342 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ABCB11O95342 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ABCB11O95342 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ABCB11O95342 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms