Protein–RNA interactions for Protein: O94972

TRIM37, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM37, humanhuman

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM37O94972 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
TRIM37O94972 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
TRIM37O94972 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
TRIM37O94972 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
TRIM37O94972 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
TRIM37O94972 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
TRIM37O94972 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
TRIM37O94972 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.66■■■□□ 2.98
TRIM37O94972 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
TRIM37O94972 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
TRIM37O94972 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
TRIM37O94972 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
TRIM37O94972 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
TRIM37O94972 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
TRIM37O94972 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
TRIM37O94972 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
TRIM37O94972 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
TRIM37O94972 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
TRIM37O94972 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
TRIM37O94972 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
TRIM37O94972 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
TRIM37O94972 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
TRIM37O94972 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
TRIM37O94972 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
TRIM37O94972 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
TRIM37O94972 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
TRIM37O94972 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
TRIM37O94972 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
TRIM37O94972 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
TRIM37O94972 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
TRIM37O94972 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
TRIM37O94972 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
TRIM37O94972 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
TRIM37O94972 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
TRIM37O94972 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
TRIM37O94972 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
TRIM37O94972 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
TRIM37O94972 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
TRIM37O94972 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
TRIM37O94972 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
TRIM37O94972 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
TRIM37O94972 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
TRIM37O94972 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
TRIM37O94972 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
TRIM37O94972 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
TRIM37O94972 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
TRIM37O94972 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
TRIM37O94972 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
TRIM37O94972 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
TRIM37O94972 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
TRIM37O94972 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
TRIM37O94972 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
TRIM37O94972 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
TRIM37O94972 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
TRIM37O94972 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
TRIM37O94972 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
TRIM37O94972 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
TRIM37O94972 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
TRIM37O94972 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
TRIM37O94972 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
TRIM37O94972 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
TRIM37O94972 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
TRIM37O94972 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
TRIM37O94972 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
TRIM37O94972 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
TRIM37O94972 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
TRIM37O94972 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
TRIM37O94972 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
TRIM37O94972 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
TRIM37O94972 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
TRIM37O94972 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
TRIM37O94972 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
TRIM37O94972 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
TRIM37O94972 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
TRIM37O94972 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
TRIM37O94972 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
TRIM37O94972 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
TRIM37O94972 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
TRIM37O94972 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC33.46■■■□□ 2.95
TRIM37O94972 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
TRIM37O94972 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
TRIM37O94972 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
TRIM37O94972 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
TRIM37O94972 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
TRIM37O94972 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
TRIM37O94972 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
TRIM37O94972 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
TRIM37O94972 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
TRIM37O94972 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
TRIM37O94972 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
TRIM37O94972 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
TRIM37O94972 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
TRIM37O94972 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
TRIM37O94972 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
TRIM37O94972 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
TRIM37O94972 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
TRIM37O94972 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
TRIM37O94972 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
TRIM37O94972 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
TRIM37O94972 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms