Protein–RNA interactions for Protein: O75841

UPK1B, Uroplakin-1b, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK1BO75841 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UPK1BO75841 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UPK1BO75841 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UPK1BO75841 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UPK1BO75841 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UPK1BO75841 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UPK1BO75841 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
UPK1BO75841 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UPK1BO75841 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UPK1BO75841 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UPK1BO75841 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UPK1BO75841 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UPK1BO75841 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UPK1BO75841 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UPK1BO75841 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UPK1BO75841 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UPK1BO75841 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UPK1BO75841 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UPK1BO75841 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UPK1BO75841 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UPK1BO75841 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UPK1BO75841 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UPK1BO75841 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
UPK1BO75841 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UPK1BO75841 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UPK1BO75841 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UPK1BO75841 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UPK1BO75841 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UPK1BO75841 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UPK1BO75841 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UPK1BO75841 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UPK1BO75841 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UPK1BO75841 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UPK1BO75841 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UPK1BO75841 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UPK1BO75841 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UPK1BO75841 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UPK1BO75841 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UPK1BO75841 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UPK1BO75841 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UPK1BO75841 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UPK1BO75841 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UPK1BO75841 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UPK1BO75841 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UPK1BO75841 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UPK1BO75841 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UPK1BO75841 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UPK1BO75841 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UPK1BO75841 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UPK1BO75841 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UPK1BO75841 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UPK1BO75841 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UPK1BO75841 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UPK1BO75841 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UPK1BO75841 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UPK1BO75841 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UPK1BO75841 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UPK1BO75841 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UPK1BO75841 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UPK1BO75841 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UPK1BO75841 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UPK1BO75841 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UPK1BO75841 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UPK1BO75841 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UPK1BO75841 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UPK1BO75841 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UPK1BO75841 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UPK1BO75841 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UPK1BO75841 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UPK1BO75841 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
UPK1BO75841 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
UPK1BO75841 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
UPK1BO75841 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UPK1BO75841 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UPK1BO75841 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UPK1BO75841 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UPK1BO75841 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UPK1BO75841 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UPK1BO75841 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UPK1BO75841 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UPK1BO75841 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UPK1BO75841 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UPK1BO75841 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UPK1BO75841 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UPK1BO75841 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
UPK1BO75841 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UPK1BO75841 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UPK1BO75841 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UPK1BO75841 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UPK1BO75841 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
UPK1BO75841 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UPK1BO75841 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UPK1BO75841 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UPK1BO75841 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UPK1BO75841 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UPK1BO75841 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UPK1BO75841 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UPK1BO75841 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UPK1BO75841 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UPK1BO75841 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms