Protein–RNA interactions for Protein: O75592

MYCBP2, E3 ubiquitin-protein ligase MYCBP2, humanhuman

Predictions only

Length 4,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCBP2O75592 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MYCBP2O75592 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MYCBP2O75592 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MYCBP2O75592 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MYCBP2O75592 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MYCBP2O75592 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MYCBP2O75592 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MYCBP2O75592 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MYCBP2O75592 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MYCBP2O75592 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MYCBP2O75592 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MYCBP2O75592 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MYCBP2O75592 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MYCBP2O75592 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MYCBP2O75592 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
MYCBP2O75592 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MYCBP2O75592 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MYCBP2O75592 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MYCBP2O75592 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MYCBP2O75592 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MYCBP2O75592 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MYCBP2O75592 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MYCBP2O75592 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MYCBP2O75592 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MYCBP2O75592 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MYCBP2O75592 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MYCBP2O75592 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MYCBP2O75592 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MYCBP2O75592 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MYCBP2O75592 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MYCBP2O75592 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYCBP2O75592 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYCBP2O75592 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MYCBP2O75592 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYCBP2O75592 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYCBP2O75592 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MYCBP2O75592 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYCBP2O75592 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYCBP2O75592 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MYCBP2O75592 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYCBP2O75592 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYCBP2O75592 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYCBP2O75592 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MYCBP2O75592 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYCBP2O75592 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYCBP2O75592 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYCBP2O75592 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYCBP2O75592 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYCBP2O75592 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYCBP2O75592 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYCBP2O75592 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYCBP2O75592 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MYCBP2O75592 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MYCBP2O75592 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MYCBP2O75592 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MYCBP2O75592 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MYCBP2O75592 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MYCBP2O75592 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MYCBP2O75592 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MYCBP2O75592 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MYCBP2O75592 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MYCBP2O75592 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MYCBP2O75592 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MYCBP2O75592 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MYCBP2O75592 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MYCBP2O75592 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MYCBP2O75592 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MYCBP2O75592 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MYCBP2O75592 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MYCBP2O75592 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MYCBP2O75592 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MYCBP2O75592 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYCBP2O75592 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYCBP2O75592 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYCBP2O75592 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYCBP2O75592 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYCBP2O75592 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYCBP2O75592 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYCBP2O75592 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYCBP2O75592 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYCBP2O75592 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYCBP2O75592 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYCBP2O75592 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYCBP2O75592 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYCBP2O75592 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYCBP2O75592 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYCBP2O75592 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MYCBP2O75592 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MYCBP2O75592 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MYCBP2O75592 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MYCBP2O75592 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MYCBP2O75592 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MYCBP2O75592 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MYCBP2O75592 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MYCBP2O75592 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MYCBP2O75592 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MYCBP2O75592 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MYCBP2O75592 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MYCBP2O75592 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MYCBP2O75592 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms