Protein–RNA interactions for Protein: O75161

NPHP4, Nephrocystin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP4O75161 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
NPHP4O75161 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
NPHP4O75161 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
NPHP4O75161 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
NPHP4O75161 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
NPHP4O75161 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
NPHP4O75161 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC36.89■■■■□ 3.5
NPHP4O75161 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
NPHP4O75161 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
NPHP4O75161 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC36.88■■■■□ 3.49
NPHP4O75161 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
NPHP4O75161 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
NPHP4O75161 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
NPHP4O75161 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC36.87■■■■□ 3.49
NPHP4O75161 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
NPHP4O75161 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
NPHP4O75161 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
NPHP4O75161 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.86■■■■□ 3.49
NPHP4O75161 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC36.86■■■■□ 3.49
NPHP4O75161 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
NPHP4O75161 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
NPHP4O75161 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
NPHP4O75161 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC36.85■■■■□ 3.49
NPHP4O75161 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
NPHP4O75161 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
NPHP4O75161 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC36.84■■■■□ 3.49
NPHP4O75161 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
NPHP4O75161 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
NPHP4O75161 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
NPHP4O75161 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
NPHP4O75161 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
NPHP4O75161 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC36.82■■■■□ 3.48
NPHP4O75161 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.48
NPHP4O75161 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
NPHP4O75161 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
NPHP4O75161 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
NPHP4O75161 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC36.8■■■■□ 3.48
NPHP4O75161 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
NPHP4O75161 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
NPHP4O75161 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
NPHP4O75161 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
NPHP4O75161 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
NPHP4O75161 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
NPHP4O75161 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
NPHP4O75161 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
NPHP4O75161 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
NPHP4O75161 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
NPHP4O75161 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
NPHP4O75161 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
NPHP4O75161 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
NPHP4O75161 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC36.76■■■■□ 3.48
NPHP4O75161 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
NPHP4O75161 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
NPHP4O75161 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
NPHP4O75161 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
NPHP4O75161 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
NPHP4O75161 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
NPHP4O75161 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC36.74■■■■□ 3.47
NPHP4O75161 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
NPHP4O75161 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
NPHP4O75161 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC36.71■■■■□ 3.47
NPHP4O75161 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC36.71■■■■□ 3.47
NPHP4O75161 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
NPHP4O75161 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
NPHP4O75161 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
NPHP4O75161 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
NPHP4O75161 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
NPHP4O75161 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
NPHP4O75161 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
NPHP4O75161 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
NPHP4O75161 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
NPHP4O75161 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC36.67■■■■□ 3.46
NPHP4O75161 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
NPHP4O75161 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
NPHP4O75161 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC36.67■■■■□ 3.46
NPHP4O75161 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
NPHP4O75161 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
NPHP4O75161 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC36.66■■■■□ 3.46
NPHP4O75161 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
NPHP4O75161 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
NPHP4O75161 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
NPHP4O75161 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.64■■■■□ 3.46
NPHP4O75161 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
NPHP4O75161 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
NPHP4O75161 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
NPHP4O75161 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC36.61■■■■□ 3.45
NPHP4O75161 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
NPHP4O75161 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
NPHP4O75161 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
NPHP4O75161 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
NPHP4O75161 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
NPHP4O75161 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
NPHP4O75161 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
NPHP4O75161 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
NPHP4O75161 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC36.59■■■■□ 3.45
NPHP4O75161 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
NPHP4O75161 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
NPHP4O75161 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
NPHP4O75161 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
NPHP4O75161 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms