Protein–RNA interactions for Protein: O60906

SMPD2, Sphingomyelin phosphodiesterase 2, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD2O60906 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMPD2O60906 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMPD2O60906 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMPD2O60906 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMPD2O60906 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMPD2O60906 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMPD2O60906 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMPD2O60906 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMPD2O60906 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMPD2O60906 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMPD2O60906 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMPD2O60906 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMPD2O60906 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMPD2O60906 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMPD2O60906 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMPD2O60906 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMPD2O60906 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMPD2O60906 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SMPD2O60906 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMPD2O60906 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMPD2O60906 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMPD2O60906 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMPD2O60906 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMPD2O60906 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMPD2O60906 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMPD2O60906 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMPD2O60906 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMPD2O60906 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMPD2O60906 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMPD2O60906 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMPD2O60906 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMPD2O60906 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SMPD2O60906 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMPD2O60906 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMPD2O60906 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMPD2O60906 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMPD2O60906 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMPD2O60906 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMPD2O60906 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMPD2O60906 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMPD2O60906 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMPD2O60906 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMPD2O60906 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMPD2O60906 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMPD2O60906 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMPD2O60906 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMPD2O60906 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMPD2O60906 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMPD2O60906 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMPD2O60906 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMPD2O60906 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMPD2O60906 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMPD2O60906 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMPD2O60906 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMPD2O60906 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMPD2O60906 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMPD2O60906 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMPD2O60906 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMPD2O60906 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMPD2O60906 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMPD2O60906 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMPD2O60906 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMPD2O60906 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMPD2O60906 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMPD2O60906 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMPD2O60906 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMPD2O60906 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SMPD2O60906 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMPD2O60906 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMPD2O60906 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMPD2O60906 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMPD2O60906 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMPD2O60906 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMPD2O60906 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMPD2O60906 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMPD2O60906 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMPD2O60906 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMPD2O60906 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMPD2O60906 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMPD2O60906 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMPD2O60906 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMPD2O60906 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SMPD2O60906 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMPD2O60906 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMPD2O60906 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMPD2O60906 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMPD2O60906 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMPD2O60906 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMPD2O60906 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMPD2O60906 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMPD2O60906 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMPD2O60906 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMPD2O60906 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMPD2O60906 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SMPD2O60906 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMPD2O60906 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMPD2O60906 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMPD2O60906 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMPD2O60906 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMPD2O60906 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms