Protein–RNA interactions for Protein: O60383

GDF9, Growth/differentiation factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF9O60383 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GDF9O60383 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GDF9O60383 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
GDF9O60383 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
GDF9O60383 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GDF9O60383 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GDF9O60383 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
GDF9O60383 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GDF9O60383 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
GDF9O60383 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GDF9O60383 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GDF9O60383 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GDF9O60383 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GDF9O60383 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GDF9O60383 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
GDF9O60383 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GDF9O60383 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GDF9O60383 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GDF9O60383 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
GDF9O60383 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
GDF9O60383 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GDF9O60383 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GDF9O60383 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GDF9O60383 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GDF9O60383 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GDF9O60383 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GDF9O60383 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GDF9O60383 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GDF9O60383 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GDF9O60383 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
GDF9O60383 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GDF9O60383 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GDF9O60383 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GDF9O60383 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GDF9O60383 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GDF9O60383 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GDF9O60383 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GDF9O60383 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GDF9O60383 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GDF9O60383 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GDF9O60383 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GDF9O60383 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GDF9O60383 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GDF9O60383 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GDF9O60383 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GDF9O60383 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GDF9O60383 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GDF9O60383 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GDF9O60383 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GDF9O60383 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
GDF9O60383 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GDF9O60383 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GDF9O60383 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GDF9O60383 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GDF9O60383 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
GDF9O60383 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GDF9O60383 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GDF9O60383 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GDF9O60383 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
GDF9O60383 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GDF9O60383 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GDF9O60383 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GDF9O60383 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GDF9O60383 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GDF9O60383 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GDF9O60383 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GDF9O60383 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GDF9O60383 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GDF9O60383 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GDF9O60383 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GDF9O60383 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GDF9O60383 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GDF9O60383 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GDF9O60383 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
GDF9O60383 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GDF9O60383 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GDF9O60383 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GDF9O60383 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GDF9O60383 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
GDF9O60383 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GDF9O60383 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GDF9O60383 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
GDF9O60383 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GDF9O60383 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GDF9O60383 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GDF9O60383 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
GDF9O60383 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GDF9O60383 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GDF9O60383 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GDF9O60383 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GDF9O60383 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GDF9O60383 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GDF9O60383 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GDF9O60383 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
GDF9O60383 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GDF9O60383 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GDF9O60383 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
GDF9O60383 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GDF9O60383 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GDF9O60383 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms