Protein–RNA interactions for Protein: O43915

VEGFD, Vascular endothelial growth factor D, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFDO43915 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VEGFDO43915 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VEGFDO43915 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VEGFDO43915 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VEGFDO43915 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VEGFDO43915 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VEGFDO43915 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VEGFDO43915 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VEGFDO43915 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
VEGFDO43915 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VEGFDO43915 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VEGFDO43915 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VEGFDO43915 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VEGFDO43915 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VEGFDO43915 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VEGFDO43915 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VEGFDO43915 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
VEGFDO43915 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VEGFDO43915 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VEGFDO43915 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VEGFDO43915 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VEGFDO43915 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VEGFDO43915 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
VEGFDO43915 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
VEGFDO43915 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VEGFDO43915 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VEGFDO43915 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VEGFDO43915 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VEGFDO43915 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VEGFDO43915 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VEGFDO43915 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VEGFDO43915 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VEGFDO43915 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VEGFDO43915 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VEGFDO43915 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VEGFDO43915 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VEGFDO43915 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VEGFDO43915 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VEGFDO43915 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VEGFDO43915 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VEGFDO43915 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VEGFDO43915 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VEGFDO43915 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VEGFDO43915 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VEGFDO43915 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VEGFDO43915 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VEGFDO43915 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VEGFDO43915 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
VEGFDO43915 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VEGFDO43915 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VEGFDO43915 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VEGFDO43915 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VEGFDO43915 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
VEGFDO43915 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
VEGFDO43915 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VEGFDO43915 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
VEGFDO43915 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VEGFDO43915 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VEGFDO43915 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VEGFDO43915 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VEGFDO43915 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VEGFDO43915 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VEGFDO43915 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VEGFDO43915 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
VEGFDO43915 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
VEGFDO43915 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VEGFDO43915 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VEGFDO43915 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VEGFDO43915 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VEGFDO43915 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VEGFDO43915 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VEGFDO43915 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VEGFDO43915 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VEGFDO43915 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VEGFDO43915 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VEGFDO43915 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VEGFDO43915 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VEGFDO43915 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VEGFDO43915 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VEGFDO43915 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VEGFDO43915 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VEGFDO43915 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VEGFDO43915 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VEGFDO43915 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VEGFDO43915 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VEGFDO43915 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VEGFDO43915 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VEGFDO43915 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VEGFDO43915 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VEGFDO43915 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VEGFDO43915 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VEGFDO43915 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VEGFDO43915 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VEGFDO43915 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VEGFDO43915 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VEGFDO43915 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
VEGFDO43915 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VEGFDO43915 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VEGFDO43915 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VEGFDO43915 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms