Protein–RNA interactions for Protein: O15552

FFAR2, Free fatty acid receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FFAR2O15552 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FFAR2O15552 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FFAR2O15552 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FFAR2O15552 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FFAR2O15552 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FFAR2O15552 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FFAR2O15552 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FFAR2O15552 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FFAR2O15552 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FFAR2O15552 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FFAR2O15552 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FFAR2O15552 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FFAR2O15552 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FFAR2O15552 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FFAR2O15552 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FFAR2O15552 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FFAR2O15552 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FFAR2O15552 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FFAR2O15552 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FFAR2O15552 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FFAR2O15552 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FFAR2O15552 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FFAR2O15552 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FFAR2O15552 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FFAR2O15552 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FFAR2O15552 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
FFAR2O15552 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FFAR2O15552 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FFAR2O15552 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FFAR2O15552 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FFAR2O15552 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FFAR2O15552 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FFAR2O15552 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FFAR2O15552 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FFAR2O15552 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FFAR2O15552 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FFAR2O15552 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FFAR2O15552 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FFAR2O15552 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FFAR2O15552 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FFAR2O15552 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FFAR2O15552 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FFAR2O15552 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FFAR2O15552 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FFAR2O15552 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
FFAR2O15552 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FFAR2O15552 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FFAR2O15552 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FFAR2O15552 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FFAR2O15552 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FFAR2O15552 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FFAR2O15552 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FFAR2O15552 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FFAR2O15552 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FFAR2O15552 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
FFAR2O15552 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FFAR2O15552 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
FFAR2O15552 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FFAR2O15552 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FFAR2O15552 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FFAR2O15552 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FFAR2O15552 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FFAR2O15552 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FFAR2O15552 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FFAR2O15552 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
FFAR2O15552 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FFAR2O15552 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FFAR2O15552 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FFAR2O15552 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FFAR2O15552 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
FFAR2O15552 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FFAR2O15552 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FFAR2O15552 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
FFAR2O15552 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FFAR2O15552 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FFAR2O15552 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FFAR2O15552 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FFAR2O15552 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FFAR2O15552 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FFAR2O15552 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FFAR2O15552 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FFAR2O15552 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FFAR2O15552 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FFAR2O15552 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FFAR2O15552 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FFAR2O15552 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FFAR2O15552 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FFAR2O15552 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FFAR2O15552 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FFAR2O15552 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
FFAR2O15552 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FFAR2O15552 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FFAR2O15552 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FFAR2O15552 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
FFAR2O15552 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FFAR2O15552 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FFAR2O15552 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FFAR2O15552 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FFAR2O15552 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FFAR2O15552 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 991.6 ms