Protein–RNA interactions for Protein: O15111

CHUK, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHUKO15111 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CHUKO15111 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHUKO15111 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHUKO15111 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHUKO15111 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CHUKO15111 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHUKO15111 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHUKO15111 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHUKO15111 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHUKO15111 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHUKO15111 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHUKO15111 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHUKO15111 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CHUKO15111 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHUKO15111 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHUKO15111 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHUKO15111 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHUKO15111 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHUKO15111 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHUKO15111 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHUKO15111 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHUKO15111 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHUKO15111 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHUKO15111 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHUKO15111 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHUKO15111 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHUKO15111 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHUKO15111 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHUKO15111 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHUKO15111 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHUKO15111 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHUKO15111 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHUKO15111 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHUKO15111 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHUKO15111 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHUKO15111 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHUKO15111 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHUKO15111 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHUKO15111 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHUKO15111 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHUKO15111 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHUKO15111 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHUKO15111 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHUKO15111 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHUKO15111 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHUKO15111 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHUKO15111 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHUKO15111 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHUKO15111 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHUKO15111 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHUKO15111 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHUKO15111 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CHUKO15111 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CHUKO15111 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHUKO15111 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHUKO15111 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHUKO15111 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHUKO15111 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHUKO15111 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHUKO15111 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHUKO15111 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHUKO15111 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHUKO15111 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHUKO15111 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHUKO15111 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHUKO15111 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHUKO15111 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHUKO15111 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHUKO15111 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHUKO15111 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHUKO15111 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHUKO15111 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHUKO15111 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHUKO15111 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHUKO15111 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHUKO15111 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHUKO15111 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHUKO15111 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHUKO15111 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHUKO15111 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHUKO15111 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHUKO15111 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHUKO15111 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHUKO15111 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CHUKO15111 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHUKO15111 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CHUKO15111 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CHUKO15111 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHUKO15111 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHUKO15111 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHUKO15111 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHUKO15111 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHUKO15111 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CHUKO15111 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHUKO15111 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHUKO15111 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHUKO15111 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHUKO15111 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHUKO15111 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHUKO15111 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.4 ms