Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ANKRD28O15084 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ANKRD28O15084 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ANKRD28O15084 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ANKRD28O15084 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ANKRD28O15084 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ANKRD28O15084 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ANKRD28O15084 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ANKRD28O15084 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ANKRD28O15084 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ANKRD28O15084 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ANKRD28O15084 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ANKRD28O15084 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ANKRD28O15084 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ANKRD28O15084 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ANKRD28O15084 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ANKRD28O15084 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ANKRD28O15084 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ANKRD28O15084 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ANKRD28O15084 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ANKRD28O15084 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ANKRD28O15084 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ANKRD28O15084 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ANKRD28O15084 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ANKRD28O15084 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ANKRD28O15084 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ANKRD28O15084 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ANKRD28O15084 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ANKRD28O15084 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ANKRD28O15084 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ANKRD28O15084 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ANKRD28O15084 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ANKRD28O15084 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ANKRD28O15084 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ANKRD28O15084 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ANKRD28O15084 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ANKRD28O15084 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ANKRD28O15084 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ANKRD28O15084 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ANKRD28O15084 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ANKRD28O15084 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ANKRD28O15084 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ANKRD28O15084 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ANKRD28O15084 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ANKRD28O15084 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ANKRD28O15084 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ANKRD28O15084 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ANKRD28O15084 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ANKRD28O15084 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ANKRD28O15084 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ANKRD28O15084 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ANKRD28O15084 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ANKRD28O15084 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ANKRD28O15084 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ANKRD28O15084 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ANKRD28O15084 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ANKRD28O15084 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ANKRD28O15084 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ANKRD28O15084 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ANKRD28O15084 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ANKRD28O15084 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ANKRD28O15084 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ANKRD28O15084 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ANKRD28O15084 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ANKRD28O15084 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ANKRD28O15084 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ANKRD28O15084 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ANKRD28O15084 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ANKRD28O15084 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ANKRD28O15084 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ANKRD28O15084 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ANKRD28O15084 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ANKRD28O15084 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ANKRD28O15084 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ANKRD28O15084 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ANKRD28O15084 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ANKRD28O15084 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ANKRD28O15084 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ANKRD28O15084 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ANKRD28O15084 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ANKRD28O15084 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ANKRD28O15084 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ANKRD28O15084 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ANKRD28O15084 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ANKRD28O15084 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ANKRD28O15084 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ANKRD28O15084 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ANKRD28O15084 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ANKRD28O15084 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ANKRD28O15084 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ANKRD28O15084 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ANKRD28O15084 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ANKRD28O15084 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ANKRD28O15084 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ANKRD28O15084 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ANKRD28O15084 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ANKRD28O15084 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ANKRD28O15084 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ANKRD28O15084 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ANKRD28O15084 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms