Protein–RNA interactions for Protein: O00515

LAD1, Ladinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAD1O00515 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
LAD1O00515 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LAD1O00515 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LAD1O00515 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LAD1O00515 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LAD1O00515 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LAD1O00515 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LAD1O00515 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LAD1O00515 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
LAD1O00515 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LAD1O00515 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LAD1O00515 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LAD1O00515 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LAD1O00515 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LAD1O00515 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LAD1O00515 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LAD1O00515 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LAD1O00515 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.76■■■□□ 2.19
LAD1O00515 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
LAD1O00515 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LAD1O00515 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LAD1O00515 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LAD1O00515 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LAD1O00515 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LAD1O00515 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
LAD1O00515 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LAD1O00515 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LAD1O00515 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
LAD1O00515 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
LAD1O00515 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LAD1O00515 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
LAD1O00515 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LAD1O00515 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LAD1O00515 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
LAD1O00515 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
LAD1O00515 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
LAD1O00515 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
LAD1O00515 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
LAD1O00515 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
LAD1O00515 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
LAD1O00515 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LAD1O00515 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LAD1O00515 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LAD1O00515 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
LAD1O00515 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LAD1O00515 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
LAD1O00515 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LAD1O00515 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LAD1O00515 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
LAD1O00515 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
LAD1O00515 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LAD1O00515 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
LAD1O00515 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
LAD1O00515 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
LAD1O00515 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
LAD1O00515 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
LAD1O00515 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
LAD1O00515 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
LAD1O00515 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
LAD1O00515 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
LAD1O00515 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
LAD1O00515 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
LAD1O00515 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
LAD1O00515 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
LAD1O00515 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
LAD1O00515 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
LAD1O00515 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
LAD1O00515 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
LAD1O00515 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
LAD1O00515 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
LAD1O00515 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LAD1O00515 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LAD1O00515 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LAD1O00515 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
LAD1O00515 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
LAD1O00515 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
LAD1O00515 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
LAD1O00515 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LAD1O00515 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LAD1O00515 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
LAD1O00515 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LAD1O00515 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LAD1O00515 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LAD1O00515 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LAD1O00515 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LAD1O00515 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LAD1O00515 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LAD1O00515 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LAD1O00515 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LAD1O00515 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LAD1O00515 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LAD1O00515 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LAD1O00515 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LAD1O00515 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LAD1O00515 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LAD1O00515 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LAD1O00515 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LAD1O00515 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LAD1O00515 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LAD1O00515 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms