Protein–RNA interactions for Protein: J3QR89

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QR89 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
J3QR89 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
J3QR89 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
J3QR89 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
J3QR89 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
J3QR89 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
J3QR89 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
J3QR89 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
J3QR89 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
J3QR89 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
J3QR89 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
J3QR89 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
J3QR89 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
J3QR89 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
J3QR89 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
J3QR89 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
J3QR89 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
J3QR89 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
J3QR89 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
J3QR89 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
J3QR89 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
J3QR89 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
J3QR89 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
J3QR89 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
J3QR89 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
J3QR89 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
J3QR89 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
J3QR89 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
J3QR89 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
J3QR89 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
J3QR89 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
J3QR89 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
J3QR89 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
J3QR89 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
J3QR89 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
J3QR89 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
J3QR89 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
J3QR89 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
J3QR89 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
J3QR89 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
J3QR89 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
J3QR89 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
J3QR89 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
J3QR89 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
J3QR89 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
J3QR89 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
J3QR89 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
J3QR89 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
J3QR89 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
J3QR89 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
J3QR89 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
J3QR89 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
J3QR89 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
J3QR89 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
J3QR89 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
J3QR89 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
J3QR89 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
J3QR89 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
J3QR89 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
J3QR89 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
J3QR89 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
J3QR89 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
J3QR89 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
J3QR89 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
J3QR89 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
J3QR89 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
J3QR89 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
J3QR89 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
J3QR89 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
J3QR89 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
J3QR89 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
J3QR89 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
J3QR89 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
J3QR89 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
J3QR89 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
J3QR89 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
J3QR89 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
J3QR89 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
J3QR89 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
J3QR89 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
J3QR89 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
J3QR89 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
J3QR89 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
J3QR89 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
J3QR89 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
J3QR89 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
J3QR89 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
J3QR89 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
J3QR89 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
J3QR89 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
J3QR89 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
J3QR89 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
J3QR89 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
J3QR89 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
J3QR89 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
J3QR89 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
J3QR89 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
J3QR89 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
J3QR89 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
J3QR89 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms