Protein–RNA interactions for Protein: H7C417

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C417 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H7C417 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
H7C417 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
H7C417 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
H7C417 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
H7C417 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
H7C417 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
H7C417 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
H7C417 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
H7C417 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
H7C417 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
H7C417 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
H7C417 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
H7C417 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
H7C417 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
H7C417 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
H7C417 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
H7C417 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
H7C417 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
H7C417 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
H7C417 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
H7C417 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
H7C417 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
H7C417 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
H7C417 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
H7C417 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
H7C417 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
H7C417 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
H7C417 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
H7C417 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
H7C417 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
H7C417 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
H7C417 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
H7C417 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
H7C417 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
H7C417 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
H7C417 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
H7C417 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
H7C417 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
H7C417 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
H7C417 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
H7C417 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
H7C417 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
H7C417 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
H7C417 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
H7C417 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
H7C417 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
H7C417 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
H7C417 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
H7C417 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
H7C417 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
H7C417 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
H7C417 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
H7C417 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
H7C417 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
H7C417 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
H7C417 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
H7C417 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
H7C417 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
H7C417 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
H7C417 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
H7C417 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
H7C417 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
H7C417 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
H7C417 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
H7C417 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
H7C417 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
H7C417 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
H7C417 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
H7C417 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
H7C417 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
H7C417 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
H7C417 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
H7C417 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H7C417 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
H7C417 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
H7C417 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H7C417 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
H7C417 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
H7C417 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
H7C417 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
H7C417 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
H7C417 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
H7C417 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
H7C417 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
H7C417 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
H7C417 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
H7C417 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
H7C417 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
H7C417 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
H7C417 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
H7C417 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
H7C417 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
H7C417 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
H7C417 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
H7C417 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
H7C417 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
H7C417 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
H7C417 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
H7C417 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms