Protein–RNA interactions for Protein: F8VRH5

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8VRH5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
F8VRH5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
F8VRH5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
F8VRH5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
F8VRH5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
F8VRH5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
F8VRH5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
F8VRH5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
F8VRH5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
F8VRH5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
F8VRH5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
F8VRH5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
F8VRH5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
F8VRH5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
F8VRH5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
F8VRH5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
F8VRH5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
F8VRH5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
F8VRH5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
F8VRH5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
F8VRH5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
F8VRH5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
F8VRH5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
F8VRH5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
F8VRH5 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
F8VRH5 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
F8VRH5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
F8VRH5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
F8VRH5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
F8VRH5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
F8VRH5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
F8VRH5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
F8VRH5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
F8VRH5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
F8VRH5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
F8VRH5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
F8VRH5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
F8VRH5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
F8VRH5 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
F8VRH5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
F8VRH5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
F8VRH5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
F8VRH5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
F8VRH5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
F8VRH5 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
F8VRH5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
F8VRH5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
F8VRH5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
F8VRH5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
F8VRH5 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
F8VRH5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
F8VRH5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
F8VRH5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
F8VRH5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
F8VRH5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
F8VRH5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
F8VRH5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
F8VRH5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
F8VRH5 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
F8VRH5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
F8VRH5 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
F8VRH5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
F8VRH5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
F8VRH5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
F8VRH5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
F8VRH5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
F8VRH5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
F8VRH5 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
F8VRH5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
F8VRH5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
F8VRH5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
F8VRH5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
F8VRH5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
F8VRH5 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
F8VRH5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
F8VRH5 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
F8VRH5 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
F8VRH5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
F8VRH5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
F8VRH5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
F8VRH5 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
F8VRH5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
F8VRH5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
F8VRH5 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
F8VRH5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
F8VRH5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
F8VRH5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
F8VRH5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
F8VRH5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
F8VRH5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
F8VRH5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
F8VRH5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
F8VRH5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
F8VRH5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
F8VRH5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
F8VRH5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
F8VRH5 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
F8VRH5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
F8VRH5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
F8VRH5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms