Protein–RNA interactions for Protein: A8K0R7

ZNF839, Zinc finger protein 839, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF839A8K0R7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNF839A8K0R7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ZNF839A8K0R7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ZNF839A8K0R7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ZNF839A8K0R7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF839A8K0R7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF839A8K0R7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF839A8K0R7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF839A8K0R7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF839A8K0R7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF839A8K0R7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF839A8K0R7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF839A8K0R7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF839A8K0R7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF839A8K0R7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF839A8K0R7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF839A8K0R7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF839A8K0R7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF839A8K0R7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF839A8K0R7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF839A8K0R7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF839A8K0R7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF839A8K0R7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF839A8K0R7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF839A8K0R7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF839A8K0R7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF839A8K0R7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF839A8K0R7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF839A8K0R7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF839A8K0R7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF839A8K0R7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF839A8K0R7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF839A8K0R7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ZNF839A8K0R7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF839A8K0R7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF839A8K0R7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF839A8K0R7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF839A8K0R7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF839A8K0R7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF839A8K0R7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF839A8K0R7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF839A8K0R7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF839A8K0R7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF839A8K0R7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF839A8K0R7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF839A8K0R7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF839A8K0R7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF839A8K0R7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF839A8K0R7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF839A8K0R7 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF839A8K0R7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF839A8K0R7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF839A8K0R7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF839A8K0R7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF839A8K0R7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF839A8K0R7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF839A8K0R7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF839A8K0R7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF839A8K0R7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF839A8K0R7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF839A8K0R7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF839A8K0R7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF839A8K0R7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF839A8K0R7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF839A8K0R7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF839A8K0R7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF839A8K0R7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF839A8K0R7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF839A8K0R7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF839A8K0R7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF839A8K0R7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF839A8K0R7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF839A8K0R7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF839A8K0R7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF839A8K0R7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF839A8K0R7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF839A8K0R7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF839A8K0R7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF839A8K0R7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF839A8K0R7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF839A8K0R7 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF839A8K0R7 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF839A8K0R7 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF839A8K0R7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ZNF839A8K0R7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ZNF839A8K0R7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF839A8K0R7 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF839A8K0R7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF839A8K0R7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF839A8K0R7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF839A8K0R7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF839A8K0R7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF839A8K0R7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF839A8K0R7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF839A8K0R7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF839A8K0R7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF839A8K0R7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF839A8K0R7 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF839A8K0R7 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF839A8K0R7 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms