Protein–RNA interactions for Protein: A6NK53

ZNF233, Zinc finger protein 233, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF233A6NK53 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZNF233A6NK53 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZNF233A6NK53 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZNF233A6NK53 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZNF233A6NK53 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
ZNF233A6NK53 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
ZNF233A6NK53 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
ZNF233A6NK53 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
ZNF233A6NK53 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
ZNF233A6NK53 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
ZNF233A6NK53 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
ZNF233A6NK53 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
ZNF233A6NK53 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
ZNF233A6NK53 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZNF233A6NK53 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZNF233A6NK53 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZNF233A6NK53 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZNF233A6NK53 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZNF233A6NK53 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZNF233A6NK53 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZNF233A6NK53 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZNF233A6NK53 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZNF233A6NK53 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
ZNF233A6NK53 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZNF233A6NK53 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZNF233A6NK53 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZNF233A6NK53 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZNF233A6NK53 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZNF233A6NK53 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZNF233A6NK53 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZNF233A6NK53 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZNF233A6NK53 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZNF233A6NK53 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ZNF233A6NK53 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ZNF233A6NK53 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ZNF233A6NK53 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
ZNF233A6NK53 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ZNF233A6NK53 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ZNF233A6NK53 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZNF233A6NK53 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZNF233A6NK53 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZNF233A6NK53 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZNF233A6NK53 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZNF233A6NK53 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZNF233A6NK53 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZNF233A6NK53 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZNF233A6NK53 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZNF233A6NK53 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZNF233A6NK53 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZNF233A6NK53 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZNF233A6NK53 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
ZNF233A6NK53 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZNF233A6NK53 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZNF233A6NK53 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZNF233A6NK53 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZNF233A6NK53 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZNF233A6NK53 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZNF233A6NK53 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZNF233A6NK53 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZNF233A6NK53 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZNF233A6NK53 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZNF233A6NK53 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZNF233A6NK53 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZNF233A6NK53 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZNF233A6NK53 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZNF233A6NK53 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
ZNF233A6NK53 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZNF233A6NK53 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
ZNF233A6NK53 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZNF233A6NK53 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZNF233A6NK53 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
ZNF233A6NK53 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZNF233A6NK53 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZNF233A6NK53 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZNF233A6NK53 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZNF233A6NK53 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZNF233A6NK53 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZNF233A6NK53 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZNF233A6NK53 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZNF233A6NK53 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZNF233A6NK53 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZNF233A6NK53 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZNF233A6NK53 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZNF233A6NK53 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZNF233A6NK53 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZNF233A6NK53 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZNF233A6NK53 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZNF233A6NK53 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZNF233A6NK53 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ZNF233A6NK53 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ZNF233A6NK53 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ZNF233A6NK53 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ZNF233A6NK53 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ZNF233A6NK53 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.56■■■□□ 2
ZNF233A6NK53 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.56■■■□□ 2
ZNF233A6NK53 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ZNF233A6NK53 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ZNF233A6NK53 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ZNF233A6NK53 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ZNF233A6NK53 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms