Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GOLGA6L9A6NEM1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GOLGA6L9A6NEM1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GOLGA6L9A6NEM1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GOLGA6L9A6NEM1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GOLGA6L9A6NEM1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GOLGA6L9A6NEM1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GOLGA6L9A6NEM1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GOLGA6L9A6NEM1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GOLGA6L9A6NEM1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GOLGA6L9A6NEM1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
GOLGA6L9A6NEM1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GOLGA6L9A6NEM1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GOLGA6L9A6NEM1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GOLGA6L9A6NEM1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GOLGA6L9A6NEM1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GOLGA6L9A6NEM1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GOLGA6L9A6NEM1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GOLGA6L9A6NEM1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GOLGA6L9A6NEM1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
GOLGA6L9A6NEM1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GOLGA6L9A6NEM1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GOLGA6L9A6NEM1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GOLGA6L9A6NEM1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GOLGA6L9A6NEM1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GOLGA6L9A6NEM1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GOLGA6L9A6NEM1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GOLGA6L9A6NEM1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GOLGA6L9A6NEM1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GOLGA6L9A6NEM1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GOLGA6L9A6NEM1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
GOLGA6L9A6NEM1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GOLGA6L9A6NEM1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GOLGA6L9A6NEM1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GOLGA6L9A6NEM1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GOLGA6L9A6NEM1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GOLGA6L9A6NEM1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
GOLGA6L9A6NEM1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GOLGA6L9A6NEM1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GOLGA6L9A6NEM1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
GOLGA6L9A6NEM1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GOLGA6L9A6NEM1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GOLGA6L9A6NEM1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GOLGA6L9A6NEM1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GOLGA6L9A6NEM1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GOLGA6L9A6NEM1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GOLGA6L9A6NEM1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GOLGA6L9A6NEM1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GOLGA6L9A6NEM1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GOLGA6L9A6NEM1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GOLGA6L9A6NEM1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GOLGA6L9A6NEM1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GOLGA6L9A6NEM1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GOLGA6L9A6NEM1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GOLGA6L9A6NEM1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GOLGA6L9A6NEM1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GOLGA6L9A6NEM1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GOLGA6L9A6NEM1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GOLGA6L9A6NEM1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GOLGA6L9A6NEM1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GOLGA6L9A6NEM1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GOLGA6L9A6NEM1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GOLGA6L9A6NEM1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GOLGA6L9A6NEM1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
GOLGA6L9A6NEM1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GOLGA6L9A6NEM1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GOLGA6L9A6NEM1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
GOLGA6L9A6NEM1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GOLGA6L9A6NEM1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GOLGA6L9A6NEM1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GOLGA6L9A6NEM1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GOLGA6L9A6NEM1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GOLGA6L9A6NEM1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GOLGA6L9A6NEM1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GOLGA6L9A6NEM1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GOLGA6L9A6NEM1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GOLGA6L9A6NEM1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GOLGA6L9A6NEM1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GOLGA6L9A6NEM1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GOLGA6L9A6NEM1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GOLGA6L9A6NEM1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GOLGA6L9A6NEM1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GOLGA6L9A6NEM1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GOLGA6L9A6NEM1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GOLGA6L9A6NEM1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GOLGA6L9A6NEM1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GOLGA6L9A6NEM1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
GOLGA6L9A6NEM1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
GOLGA6L9A6NEM1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GOLGA6L9A6NEM1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GOLGA6L9A6NEM1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GOLGA6L9A6NEM1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GOLGA6L9A6NEM1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GOLGA6L9A6NEM1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GOLGA6L9A6NEM1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GOLGA6L9A6NEM1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GOLGA6L9A6NEM1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GOLGA6L9A6NEM1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GOLGA6L9A6NEM1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GOLGA6L9A6NEM1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.6 ms