Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
PSDA5PKW4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
PSDA5PKW4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
PSDA5PKW4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
PSDA5PKW4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
PSDA5PKW4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
PSDA5PKW4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
PSDA5PKW4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
PSDA5PKW4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
PSDA5PKW4 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
PSDA5PKW4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
PSDA5PKW4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC33.22■■■□□ 2.91
PSDA5PKW4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
PSDA5PKW4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
PSDA5PKW4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
PSDA5PKW4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
PSDA5PKW4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
PSDA5PKW4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
PSDA5PKW4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
PSDA5PKW4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
PSDA5PKW4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
PSDA5PKW4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
PSDA5PKW4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
PSDA5PKW4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
PSDA5PKW4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
PSDA5PKW4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
PSDA5PKW4 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
PSDA5PKW4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
PSDA5PKW4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
PSDA5PKW4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
PSDA5PKW4 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
PSDA5PKW4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
PSDA5PKW4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
PSDA5PKW4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
PSDA5PKW4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
PSDA5PKW4 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
PSDA5PKW4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
PSDA5PKW4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC33.11■■■□□ 2.89
PSDA5PKW4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
PSDA5PKW4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
PSDA5PKW4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
PSDA5PKW4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
PSDA5PKW4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
PSDA5PKW4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
PSDA5PKW4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
PSDA5PKW4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
PSDA5PKW4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
PSDA5PKW4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
PSDA5PKW4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
PSDA5PKW4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
PSDA5PKW4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
PSDA5PKW4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
PSDA5PKW4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
PSDA5PKW4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
PSDA5PKW4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
PSDA5PKW4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
PSDA5PKW4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC33.04■■■□□ 2.88
PSDA5PKW4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
PSDA5PKW4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
PSDA5PKW4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
PSDA5PKW4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
PSDA5PKW4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
PSDA5PKW4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
PSDA5PKW4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
PSDA5PKW4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
PSDA5PKW4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
PSDA5PKW4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
PSDA5PKW4 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
PSDA5PKW4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
PSDA5PKW4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
PSDA5PKW4 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
PSDA5PKW4 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
PSDA5PKW4 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
PSDA5PKW4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC32.96■■■□□ 2.87
PSDA5PKW4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
PSDA5PKW4 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
PSDA5PKW4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
PSDA5PKW4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
PSDA5PKW4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC32.95■■■□□ 2.87
PSDA5PKW4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
PSDA5PKW4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
PSDA5PKW4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
PSDA5PKW4 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
PSDA5PKW4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
PSDA5PKW4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
PSDA5PKW4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
PSDA5PKW4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
PSDA5PKW4 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
PSDA5PKW4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
PSDA5PKW4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
PSDA5PKW4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
PSDA5PKW4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
PSDA5PKW4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
PSDA5PKW4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
PSDA5PKW4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
PSDA5PKW4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC32.89■■■□□ 2.86
PSDA5PKW4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
PSDA5PKW4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
PSDA5PKW4 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
PSDA5PKW4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms