Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 U1.41-201ENST00000617626 165 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 PCBP1-AS1-360ENST00000630377 598 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 DPYD-202ENST00000370192 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 SFTPD-AS1-201ENST00000608229 5001 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 ZNF160-202ENST00000418871 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 NBPF9-205ENST00000613595 4527 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 ELMOD2-201ENST00000323570 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 DOCK9-203ENST00000376460 7549 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 ZBTB25-201ENST00000394715 2094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 ARPP21-204ENST00000412048 2506 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 SLC25A12-202ENST00000422440 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 ZNF254-207ENST00000613065 4244 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 CNGA1-209ENST00000544810 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 ZNF532-224ENST00000591808 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 GRIK2-206ENST00000413795 4876 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 ZNF532-223ENST00000591230 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 DAOA-AS1-201ENST00000448407 2482 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 HP1BP3-203ENST00000375003 4822 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 KNL1-201ENST00000346991 9573 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 SOX6-201ENST00000316399 8808 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 RPL5P7-201ENST00000444235 813 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 MITF-217ENST00000531774 1074 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 RN7SL208P-201ENST00000577964 296 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 HNF1A-AS1-205ENST00000619441 343 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 ABLIM1-202ENST00000369252 7690 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 AKAP17BP-201ENST00000431706 2719 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 CLCC1-204ENST00000369968 4151 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 SLC12A1-202ENST00000380993 4707 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 PCBP1-AS1-210ENST00000416395 2451 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 PPFIA2-219ENST00000550359 3808 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 DCX-203ENST00000371993 9231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 FOXJ3-204ENST00000372572 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 FAM229B-201ENST00000368656 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 PBX1-221ENST00000612123 6062 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 LINC00649-203ENST00000427447 9124 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 RASGEF1B-214ENST00000638048 2386 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 CEACAM1-207ENST00000403444 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 AC008147.2-201ENST00000552061 4713 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 CSDE1-203ENST00000358528 4076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 DDX60-201ENST00000393743 6071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 MAK-204ENST00000536370 3767 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 AGBL4-201ENST00000334103 881 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 PRPS1-202ENST00000372419 628 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 AC005042.1-201ENST00000393397 800 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 GCNT1P4-201ENST00000404096 329 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 CKS1BP5-201ENST00000434172 273 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 ZBTB40-IT1-201ENST00000438551 273 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 IGKV3D-7-201ENST00000443397 384 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 AL353152.1-201ENST00000455973 470 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 AL591473.1-201ENST00000464297 313 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 AC010325.1-202ENST00000562076 279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
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MKRN4PQ13434 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 SNHG5-214ENST00000623001 598 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 LINC02495-203ENST00000636704 242 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 DAZ1-201ENST00000382510 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 DNAJC15-201ENST00000379221 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 KAT6B-203ENST00000372714 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 ALB-202ENST00000401494 1659 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 AMY1B-201ENST00000330330 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 ADA2-210ENST00000610390 4137 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 FOXP2-207ENST00000393494 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 AL359195.2-201ENST00000623657 4412 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 ATP1B4-203ENST00000539306 4644 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 AMOT-203ENST00000371959 7319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 CARF-208ENST00000428585 2513 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 NOL8-208ENST00000442668 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 TNRC6A-201ENST00000315183 8303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 ZNF490-201ENST00000311437 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 ZSCAN26-204ENST00000614088 2321 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 ZNF227-202ENST00000391961 2993 ntTSL 4 BASIC7.2□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 MIR541-201ENST00000401360 84 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 AC245028.1-201ENST00000423259 256 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 LINC02025-201ENST00000488348 360 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 SCARNA21.2-201ENST00000516600 166 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 AC018558.1-201ENST00000562591 459 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
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