Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 TCF7L2-220ENST00000543371 4037 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CACNB1Q02641 FABP2-201ENST00000274024 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CACNB1Q02641 TSC1-203ENST00000440111 8463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CACNB1Q02641 LRRC37A3-203ENST00000339474 2589 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CACNB1Q02641 LRBA-209ENST00000510413 10032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CACNB1Q02641 FANCD2-201ENST00000287647 5219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CACNB1Q02641 ASAH1-265ENST00000637922 2297 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CACNB1Q02641 DNA2-208ENST00000551118 3468 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CACNB1Q02641 PTPN3-203ENST00000412145 8765 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CACNB1Q02641 FBXW7-203ENST00000296555 3572 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CACNB1Q02641 AL359263.1-201ENST00000441188 2796 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CACNB1Q02641 HERC2-201ENST00000261609 15337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CACNB1Q02641 ALKBH8-205ENST00000428149 4079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CACNB1Q02641 AP2B1-215ENST00000616681 3267 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CACNB1Q02641 SLC26A3-201ENST00000340010 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CACNB1Q02641 HELLS-205ENST00000394036 3131 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CACNB1Q02641 MFAP3L-203ENST00000393704 5827 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CACNB1Q02641 WDR63-201ENST00000294664 2995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CACNB1Q02641 AL133383.2-201ENST00000622958 2336 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CACNB1Q02641 DDX42-203ENST00000457800 3323 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CACNB1Q02641 KLHL4-201ENST00000373114 2445 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CACNB1Q02641 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CACNB1Q02641 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CACNB1Q02641 NPIPB5-205ENST00000424340 3801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CACNB1Q02641 RPL23AP52-201ENST00000439311 478 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CACNB1Q02641 FAM107B-217ENST00000478076 790 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CACNB1Q02641 RPS27P20-201ENST00000492051 246 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CACNB1Q02641 AC108022.1-201ENST00000493466 478 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CACNB1Q02641 RNA5SP278-201ENST00000517055 102 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CACNB1Q02641 AL133163.3-201ENST00000556448 504 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CACNB1Q02641 PDE6G-203ENST00000571224 526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CACNB1Q02641 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CACNB1Q02641 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CACNB1Q02641 LINC01984-201ENST00000583863 301 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CACNB1Q02641 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CACNB1Q02641 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CACNB1Q02641 AL354718.1-201ENST00000619764 589 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CACNB1Q02641 ATAD1-202ENST00000328142 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CACNB1Q02641 ZNF121-202ENST00000586602 7177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CACNB1Q02641 ARMCX5-201ENST00000246174 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CACNB1Q02641 NCOA7-208ENST00000438495 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CACNB1Q02641 KIAA0391-203ENST00000534898 2611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CACNB1Q02641 TRIP11-201ENST00000267622 9996 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CACNB1Q02641 RASSF9-201ENST00000361228 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CACNB1Q02641 OR8B8-202ENST00000642064 3914 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CACNB1Q02641 MATR3-203ENST00000502499 2664 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CACNB1Q02641 LINC01541-202ENST00000568095 3105 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CACNB1Q02641 USP16-203ENST00000399975 2960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CACNB1Q02641 CNTN5-202ENST00000418526 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CACNB1Q02641 GRIP1-202ENST00000398016 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CACNB1Q02641 ATF3-201ENST00000336937 482 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CACNB1Q02641 RNA5SP65-201ENST00000363166 119 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CACNB1Q02641 SNORA70G-201ENST00000383923 142 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CACNB1Q02641 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CACNB1Q02641 RN7SKP151-201ENST00000410230 316 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CACNB1Q02641 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CACNB1Q02641 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CACNB1Q02641 AC005162.1-201ENST00000416513 389 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CACNB1Q02641 AL451164.1-201ENST00000417149 390 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CACNB1Q02641 KNOP1P3-201ENST00000446933 426 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CACNB1Q02641 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CACNB1Q02641 RN7SL267P-201ENST00000485107 261 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CACNB1Q02641 AC087752.2-201ENST00000521219 281 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CACNB1Q02641 ASB8-207ENST00000536953 923 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CACNB1Q02641 AC018761.4-201ENST00000585742 272 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CACNB1Q02641 AL590032.1-201ENST00000604920 252 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CACNB1Q02641 SREK1-203ENST00000380918 2433 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CACNB1Q02641 PUS7L-207ENST00000551923 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CACNB1Q02641 CNTRL-207ENST00000373855 7660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CACNB1Q02641 AP002833.3-201ENST00000625075 2265 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CACNB1Q02641 AP4E1-203ENST00000560508 6653 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CACNB1Q02641 AC109811.1-201ENST00000512833 2807 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CACNB1Q02641 OSBPL11-201ENST00000296220 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CACNB1Q02641 ESRRG-201ENST00000359162 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CACNB1Q02641 NEMP2-202ENST00000409150 6168 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CACNB1Q02641 AL591848.4-201ENST00000567832 3472 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CACNB1Q02641 TMEM67-205ENST00000453321 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CACNB1Q02641 MCCC1-210ENST00000492597 2774 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CACNB1Q02641 UTP14C-201ENST00000521776 5529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
CACNB1Q02641 DAZ1-206ENST00000620725 1891 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CACNB1Q02641 ZFP37-201ENST00000374227 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
CACNB1Q02641 GAPVD1-202ENST00000297933 6003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
CACNB1Q02641 NOVA1-206ENST00000539517 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
CACNB1Q02641 ZNF484-204ENST00000395506 4031 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CACNB1Q02641 AL596244.1-201ENST00000567068 3779 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CACNB1Q02641 IGF2BP3-201ENST00000258729 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
CACNB1Q02641 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CACNB1Q02641 NXF4-201ENST00000360035 3617 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CACNB1Q02641 SNORA70.3-201ENST00000365075 132 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CACNB1Q02641 AL135785.1-201ENST00000422554 399 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CACNB1Q02641 AC000089.1-201ENST00000424559 801 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CACNB1Q02641 TRBV29OR9-2-201ENST00000427589 333 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CACNB1Q02641 AL158835.2-201ENST00000430970 300 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CACNB1Q02641 H2AFZP5-201ENST00000446960 382 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CACNB1Q02641 PPIAP32-201ENST00000449940 472 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CACNB1Q02641 AC098583.1-201ENST00000480875 255 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CACNB1Q02641 RN7SL382P-201ENST00000482631 282 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CACNB1Q02641 RN7SL655P-201ENST00000486087 298 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CACNB1Q02641 AC010287.1-201ENST00000566916 357 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CACNB1Q02641 ARF4-AS1-203ENST00000607782 552 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 159.6 ms