Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 RNF219-AS1-202ENST00000444769 590 ntTSL 4 BASIC6.11□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 ACA64.4-201ENST00000459070 127 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 AC018638.3-201ENST00000461273 132 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 AC025458.1-201ENST00000506046 166 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 RN7SKP238-201ENST00000516483 249 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 AC136777.2-201ENST00000522979 358 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 AC110275.1-201ENST00000534420 623 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.11□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 AC010197.1-201ENST00000541860 578 ntTSL 4 BASIC6.11□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 MIR3614-201ENST00000581261 86 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 AC012313.4-201ENST00000596296 495 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 Metazoa_SRP.70-201ENST00000612622 273 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 MAK-204ENST00000536370 3767 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 MDN1-201ENST00000369393 18413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 ZC3H14-201ENST00000251038 18281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 HHLA2-209ENST00000489514 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 MACF1-232ENST00000567887 24319 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 ALB-201ENST00000295897 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 KIAA1841-205ENST00000453873 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 AP001284.1-201ENST00000528393 2118 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 LINC01478-201ENST00000587877 2068 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 ZNF534-204ENST00000433050 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 SELENOI-205ENST00000613142 8126 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 CDC42SE2-201ENST00000360515 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 ADAM21-201ENST00000603540 2658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 KDM4C-214ENST00000536108 3406 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 AL160286.3-201ENST00000569644 3294 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 ZNF615-213ENST00000602063 4094 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 SMAP1-206ENST00000619054 3150 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 FP236241.1-201ENST00000623374 7632 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 CU633967.1-211ENST00000624444 7628 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 NAT1-203ENST00000517492 2280 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 AL591135.1-201ENST00000401578 5914 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 MAP3K19-204ENST00000392915 5030 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 SSH2-201ENST00000269033 9327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 R3HDM1-202ENST00000409478 4272 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 CCR6-201ENST00000341935 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 FAM162A-201ENST00000232125 801 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 SF3B1-202ENST00000409915 600 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 RPL7AP73-201ENST00000413490 353 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
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RABGEF1Q9UJ41 PPIAP20-201ENST00000449839 135 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 AC098847.1-201ENST00000473094 348 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
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RABGEF1Q9UJ41 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
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RABGEF1Q9UJ41 AC135584.1-201ENST00000624438 333 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
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RABGEF1Q9UJ41 LZTFL1-215ENST00000536047 4342 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 APBB2-230ENST00000543538 6992 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 MCM10-202ENST00000378714 4547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 SLCO1C1-208ENST00000545102 2868 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 LGI1-202ENST00000371418 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 AC091045.1-201ENST00000561460 2277 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 AC007557.3-201ENST00000418591 3135 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 BBX-201ENST00000325805 3517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 C15orf41-201ENST00000338183 2578 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 RN7SKP128-201ENST00000364270 303 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 RNU105B-201ENST00000364478 208 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 CDC123-202ENST00000378900 933 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 RNU2-22P-201ENST00000411266 212 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 MYL6P5-201ENST00000412707 459 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 AL133482.1-201ENST00000415988 498 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 AL590999.1-205ENST00000420293 440 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 AL451062.2-201ENST00000427515 271 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 SDC4P-201ENST00000453285 601 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 RN7SL284P-201ENST00000498823 275 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 AC122710.1-201ENST00000510622 553 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP434-201ENST00000516647 121 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC6.09□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 SNHG1-204ENST00000537068 629 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 AF123462.1-201ENST00000554307 446 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
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