Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ6

KRTAP4-11, Keratin-associated protein 4-11, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-11Q9BYQ6 DGKK-201ENST00000611977 7407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 ADH6-203ENST00000394899 2802 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 KIAA1841-203ENST00000402291 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 AC055716.2-201ENST00000552545 2441 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 DNMBP-204ENST00000636706 5437 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 PTPRM-203ENST00000400060 5030 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 SCMH1-206ENST00000372596 3323 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 NEDD4L-206ENST00000431212 3338 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 MATR3-229ENST00000361059 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 SLC12A3-203ENST00000563236 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 GABPA-201ENST00000354828 5120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 AC034229.2-201ENST00000566945 2508 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 SYBU-202ENST00000399066 3435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 RAD9B-203ENST00000409246 2794 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 C1orf198-202ENST00000427697 3666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 RAPGEF4-214ENST00000538974 3920 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 SMC2-201ENST00000286398 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 RBM43-201ENST00000331426 4192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 CDH18-207ENST00000507958 3542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 EMCN-201ENST00000296420 4037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 SAXO2-201ENST00000339465 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 GRIK1-207ENST00000399914 3624 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 LRRC53-201ENST00000294635 3859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 FREM1-203ENST00000380894 2481 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 GID8-201ENST00000266069 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 ADSL-208ENST00000623063 4359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 RFC1-201ENST00000349703 4859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 ATF7IP-221ENST00000543189 4887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 OR1D2-203ENST00000641833 4887 ntAPPRIS P1 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 BRD8-204ENST00000411594 2967 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 CCPG1-212ENST00000569205 2970 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 SLC17A8-201ENST00000323346 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 EIF4G2-201ENST00000339995 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 TTC41P-205ENST00000551270 3963 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 SORBS1-211ENST00000371247 7354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 MLLT10-217ENST00000631589 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 RXFP2-201ENST00000298386 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 C8orf34-203ENST00000348340 3571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 WDR33-202ENST00000393006 3574 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 WWC1-209ENST00000521089 3562 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 FNBP1L-201ENST00000260506 5341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 SLFN11-201ENST00000308377 4910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 SZRD1-210ENST00000492354 3401 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 MAP3K13-203ENST00000424227 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 BTN2A1-201ENST00000312541 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 NLRP3-205ENST00000391827 2940 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 CSNK2A1-202ENST00000349736 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 STAT6-201ENST00000300134 4034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 CGNL1-201ENST00000281282 7224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 LINC00484-205ENST00000423719 3023 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 SH3GLB1-203ENST00000535010 6227 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 LIMCH1-202ENST00000381753 5705 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 ALDH6A1-202ENST00000553458 5499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 CACNA1C-225ENST00000480911 6811 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 FIGNL1-206ENST00000433017 3626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 ADAM7-201ENST00000175238 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 MOV10-201ENST00000357443 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 CRB1-210ENST00000538660 3397 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 ZNF189-201ENST00000259395 3115 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 CYLD-210ENST00000566206 3104 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 MLH3-210ENST00000556257 4229 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 ZNF791-202ENST00000446165 6412 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 TRAF5-202ENST00000336184 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 FBXO18-202ENST00000379999 3702 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 CREB3L2-207ENST00000616381 7133 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 GABRA4-201ENST00000264318 11973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 MCM8-205ENST00000610722 7486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 ALMS1-204ENST00000484298 12595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 RNU6-924P-201ENST00000362926 108 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 U3.3-201ENST00000362986 216 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 Y_RNA.206-201ENST00000364136 102 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 RNU1-28P-201ENST00000383861 164 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 RNU1-27P-201ENST00000383869 164 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 RNU1-1-201ENST00000383925 164 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 RNVU1-18-201ENST00000384010 164 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 RNU1-2-201ENST00000384278 164 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 RNU1-4-201ENST00000384659 164 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 RNU1-3-201ENST00000384782 164 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 MIR595-201ENST00000384905 96 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 RPL12P47-201ENST00000406185 127 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 AL031848.1-201ENST00000419034 351 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 AC094019.1-201ENST00000434678 472 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 SNORA35.1-201ENST00000458908 128 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 STXBP5L-204ENST00000471454 3813 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 RN7SL170P-201ENST00000487098 295 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 FNIP1-203ENST00000510461 3845 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 RNA5SP360-201ENST00000516555 118 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 IGHVIII-82-201ENST00000522058 250 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 SNX18P27-201ENST00000523611 779 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.3 ms