Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 HSPA8P13-201ENST00000523715 472 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 AP002892.1-201ENST00000537727 550 ntTSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 AC025272.1-201ENST00000569661 483 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 AC006270.2-201ENST00000578523 652 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 AC009977.1-201ENST00000586015 570 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 AL773545.4-201ENST00000637262 310 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 AL513478.4-201ENST00000641636 310 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 SAMSN1-201ENST00000285670 2185 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 LMNTD1-204ENST00000458174 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 OR2H1-202ENST00000377133 3021 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 SCN3A-209ENST00000639244 8854 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 PIGN-210ENST00000588571 1960 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 TJP1-204ENST00000400011 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 CNTN1-201ENST00000347616 5507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 RAD17-203ENST00000345306 2789 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 RNA5SP235-201ENST00000365411 114 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 RNU6-533P-201ENST00000384144 107 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 LINC01312-201ENST00000412745 775 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 AC138393.2-201ENST00000414742 246 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 RPL7P30-201ENST00000420888 709 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 USP12PX-201ENST00000432383 1057 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 LSM1P1-201ENST00000438629 273 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 AC006480.1-201ENST00000449887 378 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 AC007953.1-201ENST00000450500 560 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 AL080313.2-201ENST00000456440 489 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 ST13P14-201ENST00000474095 734 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 AC082650.1-201ENST00000503542 575 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 AC023794.1-201ENST00000504210 403 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 POU5F1P7-201ENST00000508759 541 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 AC018437.2-201ENST00000517369 389 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 HMGB1P19-201ENST00000517578 577 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 AC100770.1-201ENST00000532310 322 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 AC135001.1-201ENST00000544546 283 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 AL121603.1-201ENST00000553815 142 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 RPL21P7-201ENST00000557463 483 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 AC012182.1-201ENST00000570133 895 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 MIR544B-201ENST00000582372 78 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 MIR4307-201ENST00000582802 84 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 RPL26-207ENST00000583011 524 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 DLEU1_2.1-201ENST00000617920 342 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 AC004009.2-201ENST00000623016 728 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 RBMS3-205ENST00000434693 8540 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 ANKRD62P1-201ENST00000434304 1623 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 CYP3A7-CYP3A51P-201ENST00000611620 1608 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 CLHC1-201ENST00000401408 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 LRP6-201ENST00000261349 10020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 SCN1A-220ENST00000641603 12506 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 RNU6-777P-201ENST00000364265 104 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 NFIB-202ENST00000380924 840 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 GSTA9P-201ENST00000406231 611 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 AL139413.1-201ENST00000421309 217 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 AC109583.1-201ENST00000432156 268 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 AL451074.3-201ENST00000437709 472 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 AC098614.3-201ENST00000438957 440 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 DEFB109F-201ENST00000491870 277 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 ARNTL2-AS1-201ENST00000500498 804 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 CSN1S1-204ENST00000507772 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 MAL2-203ENST00000534619 578 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 LINC02460-201ENST00000543558 536 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 AL591424.2-201ENST00000617023 128 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 AL359880.1-201ENST00000621879 266 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 EFR3A-208ENST00000637848 2547 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 MS4A14-201ENST00000300187 2997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 LRRTM4-201ENST00000409088 3616 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 AC097714.1-201ENST00000511272 1647 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 CCDC146-201ENST00000285871 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 AC139713.2-215ENST00000641428 5037 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
VPS72Q15906 AL356274.2-201ENST00000624379 3752 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
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