Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 TPD52-203ENST00000448733 4339 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 NELL2-202ENST00000395487 3203 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 GLI1-201ENST00000228682 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 ZNF37A-202ENST00000361085 8738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 WDR89-204ENST00000620954 2935 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 SMG1P4-204ENST00000523028 4131 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 NHSL2-208ENST00000639939 3402 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 HBS1L-212ENST00000527578 2618 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 AL591441.1-201ENST00000618108 2247 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 ZNF189-201ENST00000259395 3115 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 BRIP1-202ENST00000577598 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 C10orf67-204ENST00000636213 3981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 SYNPO2-203ENST00000434046 3588 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 EIF4G2-208ENST00000526148 4001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 OR2T12-202ENST00000641276 5708 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 CD274-202ENST00000381577 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 ZNF519-207ENST00000590202 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 OR8J2-201ENST00000641465 2883 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 ASH1L-202ENST00000392403 10979 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 AGO1-202ENST00000373206 3996 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 MAPK10-323ENST00000641493 3207 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 DCAF10-201ENST00000242323 7393 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 FAM162A-201ENST00000232125 801 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 CDHR3-201ENST00000317716 3813 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 RNU1-108P-201ENST00000362556 161 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 RNA5SP235-201ENST00000365411 114 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 Y_RNA.545-201ENST00000384652 105 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 Y_RNA.710-201ENST00000516975 110 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 IGHV7-34-1-201ENST00000519200 350 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 MFAP5-211ENST00000540087 492 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 MIR8089-201ENST00000620165 82 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 AC244196.1-201ENST00000620569 409 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 AC074140.1-201ENST00000621617 208 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 KAT6B-205ENST00000372725 6944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 CYFIP2-210ENST00000522463 3477 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 MAGT1-201ENST00000358075 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 SORBS1-207ENST00000371239 2436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 COPG1-201ENST00000314797 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 LINC01128-205ENST00000445118 6606 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 HDAC2-AS2-208ENST00000519104 2016 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 PTPDC1-204ENST00000620992 4437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 NBPF14-209ENST00000620240 2656 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 AL355834.1-201ENST00000556602 3965 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 NPHP1-203ENST00000393272 2752 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 DLC1-215ENST00000520226 3556 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 ODF2L-203ENST00000359242 7560 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 SAMD8-201ENST00000372687 6935 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 IRF6-201ENST00000367021 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 CEACAM5-203ENST00000405816 2354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 WEE2-201ENST00000397541 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 ANKS1B-211ENST00000547776 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 AC036108.4-201ENST00000611654 2516 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 CTNND1-203ENST00000361391 6232 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 CTNND1-204ENST00000361796 6226 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 RFX4-201ENST00000229387 3378 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 AMY2A-204ENST00000622339 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 ARHGAP24-202ENST00000395183 2740 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 SLC35E3-202ENST00000398004 17791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 AC022075.1-201ENST00000500682 2830 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 NT5DC1-201ENST00000319550 6923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 KIN-201ENST00000379562 6348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 RNU1-5P-201ENST00000362684 144 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 RPS21P8-201ENST00000413365 247 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 AC011752.1-201ENST00000451476 494 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 RN7SL233P-201ENST00000469988 277 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 AC072052.1-201ENST00000496556 306 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 ADAMTS7P4-205ENST00000560651 453 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 GLUD1P8-201ENST00000585063 203 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 YPEL5P2-201ENST00000605553 359 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 RNVU1-19-201ENST00000613023 167 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 FAM27E2-201ENST00000619668 403 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 SYNE1-211ENST00000413186 4860 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 METTL14-201ENST00000388822 6669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 AC104024.1-201ENST00000428142 2201 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 MSL2-202ENST00000434835 2272 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 CCDC113-202ENST00000443128 5110 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 LINC01277-201ENST00000419957 2398 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 TMCC3-203ENST00000551457 4361 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 CLCA3P-202ENST00000466454 3412 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 RIPOR2-208ENST00000613507 5539 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 NTRK3-212ENST00000558676 4670 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 CD163-203ENST00000432237 3701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 OSBPL9-205ENST00000447887 2940 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
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