Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYP9

KRTAP9-9, Keratin-associated protein 9-9, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-9Q9BYP9 SYNE3-205ENST00000557275 13488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF2-202ENST00000611463 3737 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 CLEC2D-203ENST00000290855 5279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 CAMK4-201ENST00000282356 12240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 ELN-234ENST00000621115 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 PITX2-211ENST00000613094 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 CALD1-203ENST00000393118 4281 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 NOP2-202ENST00000382421 2736 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 FAM107B-201ENST00000181796 3785 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 HAUS6-201ENST00000380496 3756 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 TMEM108-211ENST00000515826 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 CAPRIN2-203ENST00000417045 3535 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 PDE11A-201ENST00000286063 9275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 ECM2-201ENST00000344604 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 C9orf131-205ENST00000421362 3259 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 AC092902.5-201ENST00000641650 3256 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 S1PR3-202ENST00000375846 8505 ntAPPRIS P1 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 ARAP1-205ENST00000426523 4066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 ITIH5-202ENST00000397146 6721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 DCAF8-203ENST00000368074 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 DNAH11-201ENST00000328843 13917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 AXIN1-202ENST00000354866 3324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 INSR-202ENST00000341500 8954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 KCNMA1-246ENST00000638848 4423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 WFS1-201ENST00000226760 3640 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 SEC31A-226ENST00000508479 3397 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 NOS1-202ENST00000338101 4462 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 OIP5-AS1-201ENST00000500949 8829 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 CD46-202ENST00000322918 3124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF700-202ENST00000482090 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 CBR4-201ENST00000306193 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 SLC36A2-201ENST00000335244 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 SLC26A6-207ENST00000420764 2630 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 ADIPOQ-202ENST00000444204 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 MAP3K21-201ENST00000366622 4005 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 NR1I2-203ENST00000466380 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 HERC2P2-201ENST00000613386 5181 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 SNHG14-210ENST00000546682 8842 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 CD163L1-201ENST00000313599 4615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 TRAK1-202ENST00000341421 4620 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 ATG5-204ENST00000369076 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 PRC1-201ENST00000361188 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 ADGRL4-201ENST00000370742 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 FAM200B-223ENST00000622362 4377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 FLT3-201ENST00000241453 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 ZFYVE27-203ENST00000359980 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 U3.16-201ENST00000384391 209 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 RNVU1-17-201ENST00000384619 164 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 AC012462.3-201ENST00000412951 131 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 RPL12P16-201ENST00000431098 498 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 RPL12P4-201ENST00000432629 497 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 AC147651.1-201ENST00000453149 572 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 SRP68P2-201ENST00000456184 254 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 RN7SL815P-201ENST00000470970 290 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 RN7SL751P-201ENST00000473281 284 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 RN7SL253P-201ENST00000476759 296 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 ZCCHC10-203ENST00000504170 325 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 RNU6-1206P-201ENST00000516339 103 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 IGLVI-68-201ENST00000519525 345 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 BDNF-213ENST00000525950 3829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 TMEM269-202ENST00000536543 983 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 AC090181.1-201ENST00000560446 264 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 AC009962.1-201ENST00000567327 3813 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 RN7SL557P-201ENST00000581047 286 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 AC004477.2-201ENST00000583349 192 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 AC087575.1-201ENST00000585087 229 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 AC011921.2-201ENST00000589465 152 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 FGF1-215ENST00000619447 3818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 AC005154.1-203ENST00000626245 451 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 SNORA17B-202ENST00000626886 136 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 MIR3160-2-201ENST00000637870 81 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 ATP2A3-203ENST00000359983 3290 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 GABRR1-206ENST00000611484 3259 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 FCRL5-202ENST00000368189 4424 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 AP1G1-202ENST00000393512 3593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 LINC01226-208ENST00000640623 5019 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 DNAJC9-201ENST00000372950 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 FAM35A-202ENST00000298786 3614 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 METAP2-202ENST00000323666 3601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 HAL-201ENST00000261208 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 STXBP5L-205ENST00000472879 3067 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 HPS1-204ENST00000361490 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 MAPK10-349ENST00000641767 3661 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 CASC4-201ENST00000299957 3962 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 EXTL2-202ENST00000370114 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101 ms