Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 ERBB4-205ENST00000436443 12084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 CTNND1-234ENST00000532844 6012 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 AC017071.1-201ENST00000564407 2204 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 PNN-201ENST00000216832 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 AC025569.1-202ENST00000548687 5903 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 AP000547.3-204ENST00000588548 2523 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 CORIN-207ENST00000505909 3018 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 NCKAP1L-202ENST00000545638 3612 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 RN7SKP81-201ENST00000365603 331 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 AC008171.1-201ENST00000395058 200 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 AC244157.1-201ENST00000415642 163 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 AC108516.2-201ENST00000508163 349 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 AC018797.1-201ENST00000510791 255 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 LINC01965-204ENST00000545549 575 ntTSL 4 BASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 CELF1-215ENST00000532048 3044 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 BAZ2B-202ENST00000343439 2364 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 PBRM1-206ENST00000409114 5015 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 NUP214-208ENST00000483497 3275 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 ANO3-202ENST00000525139 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 AC022784.6-204ENST00000520390 3442 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 CEP290-207ENST00000552810 7948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 STT3A-214ENST00000531491 2160 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 LINC00649-203ENST00000427447 9124 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 AP003119.3-201ENST00000566747 4192 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 CHD8-213ENST00000557364 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 SCARB2-211ENST00000638603 4284 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 CD109-201ENST00000287097 9130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 FANCM-201ENST00000267430 7111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 AC024651.2-201ENST00000562480 2098 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 BDNF-213ENST00000525950 3829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 SPATS2L-201ENST00000358677 6156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 EXD1-201ENST00000314992 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 DNM1L-205ENST00000414834 4211 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 PRICKLE2-AS3-201ENST00000473434 2496 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 IQGAP1-214ENST00000560738 3602 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 ZNF587B-201ENST00000442832 3339 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 SBNO1-203ENST00000602398 4313 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 AC126773.4-201ENST00000612545 3043 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 CLTC-201ENST00000269122 7760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 PCDH15-233ENST00000621708 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 FBXO38-218ENST00000513826 3585 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 WDR44-201ENST00000254029 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 MAPK10-380ENST00000642015 3137 ntAPPRIS P2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 STAMBP-202ENST00000394070 6691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 RNA5SP114-201ENST00000363780 113 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 RNU4-34P-201ENST00000410431 124 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 RPL18AP14-201ENST00000417685 526 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 POU5F1P5-201ENST00000445059 658 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 RNU1-88P-201ENST00000459274 128 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 RN7SL174P-201ENST00000475578 289 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 RN7SL152P-201ENST00000484176 298 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 RNA5SP206-201ENST00000516703 121 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 AL161757.5-202ENST00000556696 570 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 AC144836.1-201ENST00000575911 340 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 MIR4312-201ENST00000579909 76 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 MIR3614-201ENST00000581261 86 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 CKAP2L-201ENST00000302450 4533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 MMS22L-201ENST00000275053 8643 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 MROH3P-201ENST00000435735 2676 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 AL138756.1-201ENST00000563434 4488 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 RC3H1-203ENST00000367696 11261 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 NPHP1-204ENST00000417665 2246 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 KIAA0040-201ENST00000423313 4564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 ERI2-215ENST00000569729 2646 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 ERVFRD-1-201ENST00000472091 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 SLC11A2-201ENST00000262051 3986 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 KIAA0232-202ENST00000425103 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 ZNF260-202ENST00000523638 5666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 TMPRSS11BNL-202ENST00000510782 3202 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 NCR3LG1-201ENST00000338965 6438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 ENTPD5-207ENST00000557325 3096 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 TMED10-201ENST00000303575 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 SETDB1-205ENST00000368969 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 NSD2-224ENST00000514045 3964 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 CACNA2D3-210ENST00000490478 3557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 OR2A1-202ENST00000641044 4632 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 DNAH12-203ENST00000389536 2613 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 RBFOX2-205ENST00000405409 6932 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 FAM197Y3-202ENST00000427622 2325 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 FAM197Y7-202ENST00000433321 2325 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 NXF3-201ENST00000395065 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 MLH1-206ENST00000435176 2428 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
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