Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3T6

R3HCC1, R3H and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HCC1Q9Y3T6 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
R3HCC1Q9Y3T6 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
R3HCC1Q9Y3T6 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
R3HCC1Q9Y3T6 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
R3HCC1Q9Y3T6 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
R3HCC1Q9Y3T6 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
R3HCC1Q9Y3T6 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
R3HCC1Q9Y3T6 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
R3HCC1Q9Y3T6 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
R3HCC1Q9Y3T6 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
R3HCC1Q9Y3T6 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
R3HCC1Q9Y3T6 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
R3HCC1Q9Y3T6 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
R3HCC1Q9Y3T6 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
R3HCC1Q9Y3T6 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
R3HCC1Q9Y3T6 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
R3HCC1Q9Y3T6 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
R3HCC1Q9Y3T6 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
R3HCC1Q9Y3T6 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
R3HCC1Q9Y3T6 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
R3HCC1Q9Y3T6 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
R3HCC1Q9Y3T6 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
R3HCC1Q9Y3T6 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
R3HCC1Q9Y3T6 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
R3HCC1Q9Y3T6 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
R3HCC1Q9Y3T6 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
R3HCC1Q9Y3T6 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
R3HCC1Q9Y3T6 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
R3HCC1Q9Y3T6 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
R3HCC1Q9Y3T6 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
R3HCC1Q9Y3T6 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
R3HCC1Q9Y3T6 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
R3HCC1Q9Y3T6 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
R3HCC1Q9Y3T6 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
R3HCC1Q9Y3T6 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
R3HCC1Q9Y3T6 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
R3HCC1Q9Y3T6 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
R3HCC1Q9Y3T6 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
R3HCC1Q9Y3T6 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
R3HCC1Q9Y3T6 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
R3HCC1Q9Y3T6 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
R3HCC1Q9Y3T6 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
R3HCC1Q9Y3T6 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
R3HCC1Q9Y3T6 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
R3HCC1Q9Y3T6 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
R3HCC1Q9Y3T6 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
R3HCC1Q9Y3T6 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
R3HCC1Q9Y3T6 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
R3HCC1Q9Y3T6 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
R3HCC1Q9Y3T6 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
R3HCC1Q9Y3T6 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
R3HCC1Q9Y3T6 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
R3HCC1Q9Y3T6 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
R3HCC1Q9Y3T6 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
R3HCC1Q9Y3T6 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
R3HCC1Q9Y3T6 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
R3HCC1Q9Y3T6 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
R3HCC1Q9Y3T6 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
R3HCC1Q9Y3T6 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
R3HCC1Q9Y3T6 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
R3HCC1Q9Y3T6 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
R3HCC1Q9Y3T6 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
R3HCC1Q9Y3T6 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
R3HCC1Q9Y3T6 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
R3HCC1Q9Y3T6 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
R3HCC1Q9Y3T6 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
R3HCC1Q9Y3T6 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
R3HCC1Q9Y3T6 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
R3HCC1Q9Y3T6 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
R3HCC1Q9Y3T6 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
R3HCC1Q9Y3T6 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
R3HCC1Q9Y3T6 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
R3HCC1Q9Y3T6 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
R3HCC1Q9Y3T6 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
R3HCC1Q9Y3T6 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
R3HCC1Q9Y3T6 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
R3HCC1Q9Y3T6 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
R3HCC1Q9Y3T6 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
R3HCC1Q9Y3T6 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
R3HCC1Q9Y3T6 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
R3HCC1Q9Y3T6 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
R3HCC1Q9Y3T6 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
R3HCC1Q9Y3T6 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
R3HCC1Q9Y3T6 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
R3HCC1Q9Y3T6 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
R3HCC1Q9Y3T6 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
R3HCC1Q9Y3T6 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
R3HCC1Q9Y3T6 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
R3HCC1Q9Y3T6 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
R3HCC1Q9Y3T6 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
R3HCC1Q9Y3T6 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
R3HCC1Q9Y3T6 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
R3HCC1Q9Y3T6 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
R3HCC1Q9Y3T6 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
R3HCC1Q9Y3T6 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
R3HCC1Q9Y3T6 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
R3HCC1Q9Y3T6 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
R3HCC1Q9Y3T6 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
R3HCC1Q9Y3T6 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
R3HCC1Q9Y3T6 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms