Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DTX4Q9Y2E6 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DTX4Q9Y2E6 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DTX4Q9Y2E6 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
DTX4Q9Y2E6 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DTX4Q9Y2E6 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
DTX4Q9Y2E6 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DTX4Q9Y2E6 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
DTX4Q9Y2E6 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DTX4Q9Y2E6 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms